UP-PCR结合RFLP快速鉴定体液标本中的病原菌

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目的 设计并建立通用引物聚合酶链反应(UP-PCR)结合限制性酶切片段长度多态性(restriction fragment length polymorphisms,RFLP)酶切图谱分析快速检测无菌体液标本中常见病原菌的方法。 方法 通过对体液标本种常见病原菌16S rRNA基因保守区的序列分析,设计通用引物,对不同细菌的DNA进行UP-PCP扩增,确定标本是否有细菌感染,然后对阳性标本的扩增产物分别用不同的限制性内切酶酶切,进行RFLP分析,进一步鉴定细菌。 结果 所有对照菌株经扩增后均有1032bp长度的DNA片段产生,但经HaeⅢ 消化后的酶切图谱各异。金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌的PCR产物不能被HaeⅢ消化,但用MnⅡ消化则有不同的酶切图谱。肺炎链球菌、粪肠球菌、屎肠球菌HaeⅢ酶切图谱相同,但用AluⅠ酶切则不同。大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、粘质沙雷菌也能产生相同的酶切图谱,但DdeⅠ的酶切图谱各异。该通用引物最低可检测8CFU/ml大肠埃希菌,250CFU/ml金黄色葡萄球菌。检测了102例脑脊液标本,与培养法相比,通用引物PCR的敏感性为92.3%。结果显示,通用引物PCR结合限制性酶切分析可用于检测何鉴定临床标本种的病原菌。 结论该方法可以准确、快速地检测出体液标本中感染的病原菌。
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