不同方法检测肺癌恶性胸腔积液细胞学标本基因变异的比较研究

来源 :浙江中医药大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:userpanphilip
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目的 本研究采用ARMS法及二代测序法检测晚期非小细胞肺癌患者的恶性胸腔积液标本常见驱动基因变异情况,从而探讨非小细胞肺癌患者恶性胸腔积液中常见驱动基因的发生率,比较两种检测基因变异方法的优劣,并分析恶性胸腔积液中常见驱动基因阳性患者的临床特征及使用相应靶向药物的临床疗效。方法 收集2014年3月-2016年12月在浙江省肿瘤医院就诊的非小细胞肺癌患者104例(每例患者留取胸腔积液标本250-500ml,胸腔积液中找到癌细胞)。所有104例晚期非小细胞肺癌患者的胸腔积液标本均分别采用ARMS法及二代测序法检测其常见驱动基因的变异状态,并分析检测结果及后续靶向治疗的疗效。结果 ARMS法和二代测序法检测所有104例患者恶性胸腔积液中EGFR基因突变率分别为50%和55.8%,两种方法一致性较好(kappa=0.654),且阳性率无明显差异。两种方法检测ALK阳性率分别为13.5%和7.7%,两者一致性中等(kappa=0.496),且阳性率无明显差异。与ARMS相比,二代测序法检测EGFR基因突变的敏感性达88.5%,特异性达76.9%;检测ALK融合基因变异敏感性和特异性分别为42.9%和97.8%。两种方法检测同时阳性患者与单一方法阳性患者接受一线EGFR-TKI治疗疗效显示,两组间的PFS、ORR和DCR在统计学上无显著差异。6例仅ARMS检测EGFR阳性和5例仅二代测序法检测阳性患者TKI治疗疗效比较显示,两组的中位PFS(P=0.242)无统计学差异。9例双基因突变患者和31例单一基因突变患者接受EGFR-TKI 治疗,两组的中位 PFS(8.2 个月和 13.4 个月,P=0.113)、ORR(44.4%和64.5%,P=0.487)和DCR(88.9%和90.3%,P=1.000)比较无统计学意义,即双基因突变并不能增加患者对TKI的疗效。二代测序法检测EGFR突变丰度以5%和10%为临界值,分别比较两组患者接受一线EGFR-TKI治疗疗效显示,丰度≤10%组患者的中位PFS长于丰度>10%组P=0.002),丰度≤5%组患者的中位PFS长于丰度>5%组(P=0.006)。6例经ARMS法和/或二代测序法检测ALK基因融合或基因突变患者口服克唑替尼治疗,ORR、DCR分别达66.7%和100%。二代测序法对检测细胞学标本中肿瘤细胞极少或者无肿瘤细胞的标本敏感性较好,能检测到更多少见/罕见基因。比较12例含少见/罕见基因突变患者与28例常见基因突变患者的治疗疗效显示,常见基因突变组与少见/罕见基因突变组的中位PFS(13.4个月和8.2个月,P=0.110),ORR(41.7%和 67.9%,p=0.231)、DCR(83.3%和 92.9%,p=0.730)的差异无统计学意义。目前靶向治疗对少见/罕见突变基因的疗效尚不确切有关,需进一步的大样本研究数据证实。结论 两种方法检测胸腔积液细胞学标本中常见基因均为可行性较高的方法;与传统的ARMS方法比较,基于二代测序的技术检测EGFR和ALK等常见基因的一致性较好;二代测序法能够发现部分ARMS法未检测到的驱动基因及更多其他少见/罕见基因;胸腔积液可作为二代测序标本行基因检测,使更多患者受益于靶向治疗。
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