利用粪便DNA估算西伯利亚狍(Capreolus pygargus)种群数量和家域面积

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小兴安岭林区地处于我国温带东北部,占据着我国森林生态系统的重要地位,是我国重要的木材生产基地和森林生态功能区。随着人口增加,森林资源遭到严重地破坏。长时间过度的人为干扰严重破坏原生群落,现在绝大部分森林转变成了低质量的次生林,处于次生演替的不同阶段。森林质量和数量锐减,造成野生动物生境破坏、生境破碎化、物种数量减少、种群繁衍受到抑制。在国内种群数量的研究相对较少,并且大多关注珍稀保护动物,而对于人为干扰严重区域一些常见物种已经达到了“珍稀”程度。西伯利亚狍是小兴安岭地区仅存的两种鹿科动物(马鹿和西伯利亚狍)之一,为了维护和保障当地物种多样性和生态系统的稳定,必须实施有效手段保护和管理西伯利亚狍种群。本研究在小兴安岭凉水国家级自然保护区利用粪便DNA结合标志重捕法估算西伯利亚狍种群数量。在2016年3月和12月先后开展两次重捕实验,共获得422份粪便,利用标记重捕法(Capture软件和Capwire软件)估算西伯利亚狍种群数量,同时利用粪便DNA确定个体位置估算西伯利亚狍的冬季家域面积。研究的主要结论如下:  (1)选取已知的18个欧洲狍基因位点,其中3个同时也是西伯利亚狍基因位点作为本研究分析位点,利用15份粪便样本筛选位点,共筛选出来6个基因位点,分别为Roe1、Roe8、Roe9、BM757、MB25和OarFCB304。6个基因位点多态性信息含量在0.175-0.899之间。在所有的6个位点中Roe8、BM757、OarFCB304为高度多态性位点(PIC>0.5),Roe9和MB25为中度多态性位点(0.25≤PIC≤0.5),Roe1为低度多态性。6个基因位点同胞识别概率的数值为1.246e-08。  (2)从422份粪便样品中,得到265个基因型,扩增率为62.8%,获得77个个体。利用CAPTURE软件Mtbh(1.00)模型估算西伯利亚狍种群数量为87±7头,在95%的置信区间内西伯利亚狍的种群数量为80-112头。Capwire软件TIRM模型估算西伯利亚狍种群数量为106头,在95%的置信区间内西伯利亚狍的种群数量为94-118头。  (3)本研究共选择出现次数大于6个位置的15个个体,分别为A-O,平均重捕次数大于11次。利用R中的adehabitatHR包中的核密度法估算西伯利亚狍的家域面积,冬季西伯利亚狍的家域面积范围为16.46ha-640.33ha,N个体的家域面积最小,面积为16.46ha,F个体的家域面积最大,面积为640.33ha,平均家域面积为238.47±182.57ha。
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