大鼠精子发生早期阶段microRNA的鉴定和差异表达研究

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本课题以出生后9天的大鼠为研究对象,构建大鼠精子发生早期阶段的精原细胞与精母细胞小RNA文库,利用Solexa高通量测序技术鉴定大鼠精原细胞与精母细胞的miRNA,并利用生物信息学技术预测高表达miRNA的靶基因并对其功能进行初步分析。通过Solexa高通量技术测序后,获得全部大鼠精原细胞与精母细胞的小RNA。原始小RNA序列分别为17639958和14759321条,高质量小RNA分别是17179418和14182716条。通过生物信息学的分析,在精原细胞中鉴定了212种已知的miRNA和24种候选的miRNA;在精母细胞中鉴定了205种已知的miRNA和9种候选的miRNA。在精原细胞与精母细胞中,有108种miRNA表达具有显著差异,其中,73种miRNA在精原细胞的表达显著高于精母细胞,35种miRNA在精母细胞的表达显著高于精原细胞,126种miRNA表达的差异不显著。对两种细胞中高表达且有差异的10种miRNA的靶基因进行预测结果共选取了87个靶基因。这些靶基因功能与癌症、细胞凋亡、黏着斑连接和泛素化的信号通路相关。利用Solexa高通量技术测序对大鼠精子发生早期阶段的miRNA进行了鉴定,并进行了差异分析。这为大鼠或其他动物的精子发生的研究提供了有价值的信息,并为进一步研究miRNA在大鼠精子发生的作用和分子调控机制奠定了基础。
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