H19单核苷酸多态性与乳腺癌发病风险及血浆H19 mRNA表达水平的相关性研究

来源 :西南医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xfengxue
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目的:探讨长链非编码RNA H19单核苷酸多态性对乳腺癌发病风险及血浆H19 mRNA表达水平的影响,以便进一步深入了解乳腺癌的发病机制,从而为乳腺癌的早期筛查、早期诊断、早期预防、分子靶向治疗提供理论依据。方法:收集2015年1月到2016年1月西南医科大学附属医院收治的乳腺癌初诊患者228例,在患者未接受手术、放疗、化疗等任何处理之前采集静脉血,以同期体检中心为来源选取健康女性对照222例。利用生物信息学软件检索H19标签SNP,进一步筛选确认后纳入4个SNP位点:rs3741219、rs2107425、rs217727和rs2839698。采用基因测序的方法对筛选出的标签SNP进行基因分型。利用Hardy-Weinberg平衡定律对纳入的健康对照组进行遗传平衡性检验,判断对照组的人群代表性。通过t检验及χ2检验比较病例组和对照组一般资料、生殖因素、乳腺癌家族史等差异。通过二元logistic回归分析H19 SNP位点与乳腺癌发病风险的相关性。采用qRT-PCR方法检测90例各临床特征基本相同的乳腺癌患者血浆H19 mRNA的表达量,进而判断SNP各基因型对H19 mRNA表达水平的影响。最后采用Western-Blot方法分析H19 rs2839698对EMT相关蛋白Vimentin的影响,进一步探讨SNP在乳腺癌中的具体作用机制。结果:H19 rs3741219各基因型与乳腺癌的发病风险没有相关性(P校正>0.05)。rs217727 CT基因型可以明显降低乳腺癌的发病风险(P<0.05),而其余各基因型与乳腺癌的发病风险均没有任何相关性(P>0.05)。rs2107425 TT基因型可以明显增加乳腺癌的发病风险(P<0.05),与C等位基因相比,T等位基因可以明显增加乳腺癌的发病风险(P=0.002,OR=1.52,95%CI=1.17-1.98)。rs2839698 TT基因型相较于CC基因型可以明显增加乳腺癌的发病风险(P校正=0.03,OR校正=1.86,95%CI=1.06-3.25),其余各基因型与乳腺癌的发病风险均没有相关性(P>0.05)。进一步分层分析显示,rs217727 CT+TT基因型可以明显降低初次生育年龄>24岁乳腺癌的发病风险(P=0.03,OR=0.49,95%CI=0.27-0.91),并且可以明显降低未绝经妇女乳腺癌的发病风险(P=0.04,OR=0.52,95%CI=0.28-0.96)。rs2839698 CT+TT基因型可以增加未哺乳妇女乳腺癌的发病风险(P=0.03,OR=4.91,95%CI=1.17-20.67)。rs2107425与病例组的年龄、生殖因素以及乳腺癌家族史均无明显相关性(P>0.05)。临床病理特征分析显示,rs217727 CT基因型与ER阳性(P=0.03,OR=2.22,95%CI=1.10-4.45)明显相关,rs217727 TT基因型与肿瘤>5cm(P=0.02,OR=2.45,95%=1.13-5.33)明显相关。rs2839698 CT基因型与ER阳性相关(P=0.02,OR=2.30,95%CI=1.16-4.57),TT、CT+TT基因型均与乳腺癌肿瘤>5cm明显相关(P<0.05),而rs2107425和rs3741219与乳腺癌各临床病理特征均无明显相关性(P>0.05)。rs2839698 TT、CT+TT基因型可以明显升高乳腺癌患者血浆H19 mRNA的表达水平(P<0.05),通过Western-Blot发现rs2839698 TT、CT+TT基因型可以提高EMT间质标志蛋白Vimentin的表达水平。结论:乳腺癌发病风险与遗传因素、生殖因素明显相关。H19rs217727 CT基因型可以明显降低乳腺癌的发病风险,rs2107425 TT、rs2839698 TT基因型可以明显增加乳腺癌的发病风险。rs2839698 TT、CT+TT基因型可以明显升高乳腺癌患者血浆H19 mRNA的表达水平,并且可以升高EMT间质标志蛋白Vimentin的表达水平。
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