应用碱基淬灭探针法检测α-1抗胰蛋白酶基因342Glu→Lys突变

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目的:利用碱基淬灭探针技术建立检测编码α-1抗胰蛋白酶基因342Glu→Lys突变位点的新型诊断方法。方法:(1)方法学构建:引物、探针设计,探针3’端标记6-羧基荧光素,同时构建2个载体作为阳性对照模板,分别代表两种可能的纯合子基因型,即野生型(342Glu/Glu)和纯合突变型(342Lys/Lys)。收集338例病人全血标本,离心柱法抽提基因组DNA,PCR扩增目的产物,应用熔解曲线对结果进行分析判断。(2)方法学优化:优化PCR反应条件并检测方法的准确性和灵敏性。结果:熔解曲线分析结果显示纯合突变型(342Lys/Lys)和野生型(342Glu/Glu)分别在41.38±0.90°C及48.64±1.33°C处出现单一熔解谷;人工构建的杂合子(342Glu/Lys)在41.38±0.90°C及48.64±1.33°C处均出现熔解谷。338例病人标本均在48.64±1.33°C处出现熔解谷,与野生型阳性对照结果一致,即所有标本基因型均为342Glu/Glu。灵敏性分析结果显示模板DNA量在103拷贝时也可以看到明显的熔解谷。Kappa检验显示该方法的检测结果与DNA测序法所得结果完全一致(K=1,P=0.000)。结论:本研究所建立的方法准确、简单、经济,适合大规模对α-1抗胰蛋白酶基因342Glu→Lys突变的分型诊断。
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