探究乳腺癌中LncRNA-HOTAIR与miRNA-148b-3p交互作用

来源 :蚌埠医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:deiaw
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目的:通过生物信息学分析HOTAIR与hsa-miR-148b-3p是否存在结合,进而通过细胞学实验验证在乳腺癌细胞系中两者互作关系如何,为下一步探究两者调控机制提供方向。方法:本研究于TCGA数据库中下载高通量表达miRNA数据,根据cut-off标准(P<0.05,log2 FC>2.0),乳腺肿瘤与正常标本共检测到112个有差异性表达的miRNAs。从miRcode数据库中筛选HOTAIR靶标miRNA,其中包括miRNA-148b-3p在内55种miRNA。将上述两组数据通过Veen diagram鉴别出重叠基因即miR-148b-3p、miR-204-5p、miR-375。我们用Kaplan-Meier曲线和对数秩和检验对上述三种miRNA进行生存分析。结果表明miR-148b-3p、miR-204-5p对乳腺癌患者生存有明显影响,而miR-375无明显差异。进而在starBase数据库中我们注意到其中只有miRNA-148b-3p与HOTAIR的超保守区域显示出>10个碱基的互补性。通过双荧光素酶实验验证HOTAIR-miRNA-148b-3p、miRNA-148b-3p-ESR1在体外结合情况,另细胞学实验进一步验证上述三者在15对乳腺癌样本以及乳腺癌细胞系MCF-7的表达情况,分析表达相关性。结果:通过Veen diagram对差异表达miRNAs和HOTAIR靶标miRNAs进行重叠数据筛选,然后进行生存分析,最终得出miR-148b-3p、miR-204-5p既在乳腺癌标本中有显著表达差异又对乳腺癌患者生存有明显影响,然而在starBase数据库中我们发现只有miRNA-148b-3p与HOTAIR结合。双荧光素酶实验HOTAIR-miRNA-148b-3p均可在体外结合。细胞学实验验证在乳腺癌中HOTAIR的高表达可抑制miRNA-148b-3p的表达。结论:HOTAIR可能作为竞争性内源RNA(ceRNA)干扰miRNA-148b-3p的表达,进而调控下游基因,从而影响乳腺癌的发生发展。
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