耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌耐药基因检测及同源性分析

来源 :南京医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chendegeng1234
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目的:通过聚合酶链反应(Polymerase chain reaction,PCR)检测某院耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(Carbapenem resistant Acintebacter baumannii,CRAB)耐药基因的携带情况。通过对CRAB菌株进行同源性分析,探讨该院CRAB感染的流行与同源性情况。方法:1.收集2017年8月至2019年12月某院住院患者分离出的非重复CRAB,共纳入50株,所有分离株使用VITEK 2 Compact进行菌株鉴定、药敏试验,并使用PCR扩增固有基因OXA-51再次鉴定菌种。2.通过PCR扩增相关耐药基因(OXA-23、OXA-24、OXA-51、OXA-58、OXA-143、PER、SHV、IMP、TEM、VIM、ADC)和插入序列(ISAbla-OXA-23、ISAbla-OXA-58),经琼脂糖凝胶电泳,凝胶成像系统观察照相和分析。3.采用脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)技术对50株临床分离CRAB进行同源性分析结果:1.50株CRAB主要分离自痰液(72%),随后依次为支气管肺泡灌洗液(18%)、血(4%)、尿(2%)、引流物(2%)等。菌株主要分布科室为神经内科重症监护室(NICU)(28%)、急诊重症监护室(EICU)(22%)、重症监护3室(ICU3)(20%)。2.该院的50株CRAB中9株(18%)对检测的11种抗生素均耐药,亚胺培南、头孢他啶、头孢曲松、氨苄西林/舒巴坦、环丙沙星耐药率达100%,对头孢吡肟、哌拉西林/他唑巴坦、庆大霉素、妥布霉素耐药率均高于90%,左氧氟沙星耐药率稍低为44%。3.本研究的50株CRAB耐药基因扩增结果为:OXA-51、ADC、ISAbal-OXA-23扩增阳性率100%,OXA-23扩增阳性率超过90%,VIM、SHV扩增阳性率分别为46%、10%,TEM、IMP、PER、OXA-24、OXA-58、OXA-143、ISAbal-OXA-58未检出。4.通过PFGE对50株CRAB进行同源性分析,结果显示,可分为5个的聚类(AE),A克隆包括A1、A2亚型,共17株(34%),B克隆4株(8%),C克隆包括C1、C2亚型,共22株(44%),D克隆包括D1、D2亚型,共6株(12%),E克隆群1株(2%)。A1亚型主要分布于EICU,NICU、ICU3,A2、B克隆主要分布于ICU1,C1、C2亚型主要分布于NICU,其中C2亚型除了120病房外,在NICU、EICU、ICU3、ICU1、神经外科、呼吸内科均有分布。D1、E群分别仅分布于EICU、120病房,D2亚型主要分布于ICU3。不同型别CRAB在医院各科室分布情况显示C2型为最大的克隆分型,占所有克隆株的30%。5.2017年8月至2019年12月期间共分离出15株来源于C2克隆的CRAB,时间跨度16个月并且在该院6个病区(NICU、EICU、ICU3室、ICU1室,神经外科及呼吸内科病房)均有分布。C2亚型菌株的基因型与耐药表型基本完全相同,其中在NICU病区1周内分离的3个C2型分离株来自相邻的床位或仅隔1个床位,说明C2类型CRAB可能在该院多个科室间流行。结论:1.本研究CRAB多分离自痰液,主要分布于NICU、EICU及ICU3室。2.OXA-51、OXA-23、ADC在检测的耐药基因型中阳性率较高,可能为碳青霉烯药物和β-内酰胺类药物耐药的主要机制。3.所有CRAB的PFGE同源性分析结果分为A-E 5个聚类,C2型为最大的克隆分型。4.在2017年8月至2019年12月间,该院医疗病区间可能发生了C2型CRAB的暴发流行。
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