【摘 要】
：
目的:利用公共数据库筛选胃癌中高表达基因,确定该基因在胃癌细胞系和组织中的转录和翻译表达水平,探讨其对病人临床预后的影响,同时阐述其编码蛋白在胃癌肿瘤微环境中的分子机制,为胃癌的早期临床诊断和靶向干预治疗提供线索和思路。方法:在TCGA数据库中挑选出配对的胃癌组织样本,通过生物信息学方法分析筛选出胃癌中高表达基因CLDN6;在胃癌细胞系中检测不同细胞系CLDN6表达情况,在仁济医院病人组织样本以及
论文部分内容阅读
目的:利用公共数据库筛选胃癌中高表达基因,确定该基因在胃癌细胞系和组织中的转录和翻译表达水平,探讨其对病人临床预后的影响,同时阐述其编码蛋白在胃癌肿瘤微环境中的分子机制,为胃癌的早期临床诊断和靶向干预治疗提供线索和思路。方法:在TCGA数据库中挑选出配对的胃癌组织样本,通过生物信息学方法分析筛选出胃癌中高表达基因CLDN6;在胃癌细胞系中检测不同细胞系CLDN6表达情况,在仁济医院病人组织样本以及GEO数据中验证CLDN6在癌组织和癌旁表达情况;通过体外细胞功能实验和体内动物成瘤实验,探索CLDN6对胃癌细胞增殖和侵袭等生物学功能的影响;利用GEO公共数据库的GSEA分析,寻找CLDN6可能影响的信号通路,并通过western blot、PCR、免疫沉淀、细胞免疫荧光Ch IP等实验验证关键蛋白和基因的变化情况。结果:在TCGA数据库中我们筛选出CLDN6作为候选基因;通过表达谱和组织芯片等检测,我们发现CLDN6在肿瘤组织中相对癌旁组织中高表达;细胞功能实验、动物皮下瘤实验以及动物肝转移实验均提示CLDN6能够促进胃癌的增殖和侵袭能力;GSEA提示CLDN6高表达在Hippo信号通路数据集中存在富集,Co IP实验验证了CLDN6与LATS1/2发生相互作用,干扰CLDN6增强YAP1磷酸化进而减少YAP1进入细胞核,相关下游靶基因的激活受阻,同时YAP1能与snail1发生相互作用,促进EMT过程。结论:CLDN6在胃癌组织中相对癌旁组织高表达,并且高表达CLDN6提示病人预后不良;CLDN6通过YAP1-snail1轴能够促进肿瘤细胞的增殖和侵袭能力。
其他文献
【背景】肿瘤近红外光学成像对肿瘤的精确切除来说是一种非常重要的辅助方法,传统上,外科医生依赖于术中冰冻切片这类经验性方法来确定肿瘤组织侵犯的范围,这类检测方法不能实时、精准确定肿瘤边界范围,有时会切掉正常组织,从而导致正常功能失常;或者肿瘤组织有残余,从而导致肿瘤的复发。精确、实时地定位肿瘤的边界需要一种对肿瘤细胞有高敏感并具有良好的组织相容性的成像分子。目前,针对肿瘤的近红外光学成像的分子是单靶
目的:研究吉非替尼联合125I放射性粒子治疗肺癌A549细胞裸鼠移植瘤的有效性。方法:利用稳定表达荧光素酶的A549-luc人肺腺癌细胞建立裸鼠皮下移植瘤模型24只,20d后成瘤大小8-10mm。24只荷瘤裸鼠随机分为空白对照组6只、125I放射性粒子植入组6只,吉非替尼组6只,吉非替尼联合125I放射性粒子植入组6只。观察肿瘤生长情况,持续测量肿瘤大小变化。利用活体生物发光成像检测含荧光素酶报告
第一部分:MR动态对比增强成像在评估宫颈癌淋巴脉管浸润状态中的应用目的:探讨动态对比增强（dynamic contrast enhancement,DCE）磁共振成像（magnetic resonance imaging,MRI）术前评估宫颈癌淋巴脉管浸润（lymphovascular space invasion,LVSI）状态的临床价值。方法:收集宫颈癌68例,均在术前行DCEMRI检查,分别
目的:越来越多的证据证实了长链非编码RNAs（long non-coding RNAs,lnc RNAs）在肿瘤生物学过程中的本质调控作用。Lnc RNA PXN-AS1已被发现是胰腺癌的抑癌基因;但其在胶质母细胞瘤（glioblastoma,GBM）中的作用和机制尚不清楚。本研究旨在探究Lnc RNA PXN-AS1在胶质瘤生长增殖过程中的作用及机制。方法:通过qRT-PCR检测胶质母细胞瘤细胞
目的:肿瘤相关巨噬细胞（tumor-associated macrophages,TAMs）在肿瘤微环境中扮演者十分重要的角色,豆蛋白酶（legumain）在胃癌中高表达,且与肿瘤微环境关系密切,legumain是否通过调控TAMs影响胃癌的发生发展不甚清楚,本研究的目的是探讨legumain对于TAMs的增殖及迁移的影响,进一步研究legumain能否通过TAMs影响胃癌的发生发展。方法:应用P
SRC作为一个经典的原癌基因,编码具有酪氨酸激酶活性的c-Src蛋白。已经有多篇研究报道,c-Src在多种人类肿瘤中处于高表达状态或具有高激酶活性,并参与到癌症发生发展的多个过程中,包括细胞增殖、分化、血管生成和预后生存率等。AGO2作为miRISC复合物中的核心组分,参与小RNA介导的基因沉默和部分miRNA的生成调控。AGO2可以发生多种翻译后修饰,其中酪氨酸磷酸化修饰的研究尚处于起步阶段,并
目的:在卵巢癌网膜转移动物模型RNAseq测序结果基础上,筛选出在卵巢癌网膜转移过程中强势表达的基因——补体C1q肿瘤坏死因子相关蛋白6（Complement C1q Tumor Necrosis Factor-Related Protein 6 CTRP6）;在体外细胞水平进一步探究CTRP6通过调节网膜脂肪细胞脂代谢促进卵巢癌网膜转移的机制研究。方法:利用GO富集分析卵巢癌网膜多时点动态测序结
胰腺癌是恶性程度最高的肿瘤之一,临床上缺乏有效治疗手段,预后极差。在我国,近年来胰腺癌患者数量呈快速上升趋势,严重威胁到人类健康。它被认为是一种复杂的基因异常疾病。而对于胰腺癌的分子分型的研究有助于我们更好地理解这一种基因异常疾病。Collison于2011年提出了基于表达谱水平的胰腺癌分型标准分为三组。在之后的2016年Bailey等人同样发现Collison的分三组之一的类间质亚组（Baile
肺癌是全世界最常见的恶性肿瘤,尤其发生转移时,预后不佳。为了更好地理解其发生发展的过程以及分子机制,我们的研究目标是寻找肺癌骨转移相关的核心基因。首先,我们从GEO数据库中下载了GSE76194数据集,比较了4对高骨转移肺癌细胞系及其亲代细胞低转移细胞系之间的表达谱,利用R软件中的Limma软件包进行差异表达基因分析,获得1132差异基因,并以此为基础,构建了差异蛋白质-蛋白质相互作用网络。接着,
目的:运用WGCNA法在透明细胞癌中建立风险预测模型,判断患者的预后风险。同时运用该方法在非透明细胞癌中探究具有预后判断价值的靶点,并对其治疗意义做初步探究。方法:从TCGA官网和GEO数据库下载肾透明细胞癌、乳头状和嫌色细胞癌的m RNA测序数据和对应的临床资料,通过Limma法分析出差异表达基因（DEGs）。在TCGA数据库中,对DEGs进行WGCNA分析,获得共表达基因模块。选取与临床性状相