牛病毒性腹泻病毒NADL株囊膜糖蛋白E<,2>基因的克隆与序列鉴定

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牛病毒性腹泻病毒(BVDV),是世界范围内导致产生牛病毒性腹泻-粘膜病的瘟病毒属病原。BVDV基因组包括一个正的单链RNA,编码所有的结构蛋白和复制成分。基因组的前半部分翻译一个多聚体蛋白,并相应地加工成E0(gp48)、E1(gp25)、E2(gp53)蛋白。在这些结构蛋白中,E2蛋白被认为是与中和作用有关的囊膜蛋白。因此,对BVDV E2基因进行克隆具有重要的生物学意义。 BVDV NADL株属于致细胞病变型毒株,用MDBK细胞培养增殖BVDV,经5-6次连续传代至出现明显的细胞病变。收集细胞培养液,并浓缩病毒。从GenBank中搜寻出Deer-N21、SH9、NewYork-Ⅰ等CP型毒株的E2基因序列,根据其同源性用生物学软件Primer 5设计引物,并在引物的两端加入Bal Ⅰ和Nco Ⅰ两个酶切位点,酶切位点的存在易于对E2基因进行克隆操作。 在基因组RNA的提取和E2基因的反转录过程中,所用试剂全用DEPC处理水配制。通过RT-PCR扩增E2基因,电泳测定扩增片段的大小,经纯化后,连接于pUCm-T载体,获得重组质粒pBNE2PⅠ、pBNE2PⅡ,转化E·coli JM109,经蓝白斑筛选,挑取阳性克隆,提取质粒,直接电泳鉴定和酶切鉴定。通过对pBNE2PⅠ E2基因的进一步基因序列和核苷酸序列分析,结果表明,E2基因包括约1110个碱基,编码约370个氨基酸。 本实验通过引物设计及BVDV囊膜糖蛋白E2基因的克隆,为E2基因的进一步分子生物学分析及亚克隆奠定了的基础。
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