在劳动力市场二元分割的背景下,国有部门和非国有部门之间存在的工资差距是导致人力资本配置效率低的原因之一。近年来,尽管劳动力的流动性有所增加,但由于人力资本配置不当,中国持续遭受较高的效率损失。面对人力资本错配的现状,我国需要提高劳动力的配置效率以减少经济效率损失。因此,本文的研究目的是构建一个两部门经济增长模型,测算各部门在所有制改革时期的人力资本错配程度、错配损失的经济效率和引起损失变化的因素。为了达到这些目的,本文利用CHIP数据库和EPS平台测算两部门的人力资本存量、生产总值和物质资本存量,然后运用这些指标的对数形式代入各部门的柯布道格拉斯函数中,并利用两阶段最小二乘回归,估计各部门的生产要素产出弹性,最后计算人力资本错配程度和效应值。通过实证研究和分析发现,非国有部门的人力资本错配程度高于国有部门。另外,人力资本错配程度在我国各地区的变化趋势有所不同,经济较为发达的地区人力资本错配程较高。此外,各部门的人力资本错配程度在面临金融危机时的变化趋势有差别,国有部门的人力资本错配程度在2008年呈现下降趋势,而该错配在非国有部门中却表现为缓慢上升趋势。在人力资本错配效应方面,东部地区的人力资本错配效应最大,中部地区次之,西部地区的人力资本错配效应值最小。出现区域差异的原因是各地区的经济结构和人力资本结构差异,使得各地区的人力资本错配程度对经济效率的损失程度有所差别。最后,本文通过分析人力资本错配效应变化的几个关键时期,分解总效应发现主导效应变化的是价格效应,也就是说两部门的人力资本工资率差异导致了整体经济效率损失,由此说明同工不同酬的现象相比简单的工资差距更值得人们重视。