当今世界,科技日新月异,大部分高新技术企业提高自主创新能力的紧迫感越来越强。对于高新技术企业而言,其自主创新的源动力来源于企业的核心技术员工,而企业的整体环境和综合治理措施也决定了企业技术员工能否将其创新能力很好的发挥出来,而股权激励就是其中一个最有效的综合措施之一,因此一个合适科学合理的股权激励方案对于高新技术企业而言尤为重要。本文以高新技术企业高新兴科技集团股份有限公司为研究对象,通过案例分析讨论了股权激励与创新绩效之间的关系。以创新投入-创新转化-创新结果三个阶段作为创新绩效的衡量标准,通过企业的相关数据来讨论股权激励和创新绩效直接的关系,通过对比分析企业实施股权激励前后,其创新绩效的变化,从而进一步讨论股权激励对于企业的影响。本文探讨了限制性股票和股票期权激励对创新绩效的影响,认为:两种股权激励方案对企业创新绩效均有正面的效果,限制性股票更适合用来激励核心技术员工,对于企业高管来说,股票期权的激励则更合适。且基于上述的企业自主创新的源动力来自核心员工,所以对于高新技术企业来说,股权激励应以核心员工的激励为主,高管的激励作为辅助以达到相辅相成的作用,且在还能产生激励效应的情况下,激进的股权激励方案明显更能促进企业创新绩效的提升,更优于保守型的激励方案。文章最后对设计提高创新绩效股权激励方案提出了相关建议。