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本论文应用TaqMan探针实时荧光定量PCR对鸭瘟弱毒免疫鸭的消化道和呼吸道内双歧杆菌、芽孢杆菌、肠球菌的数量变化规律进行了研究，主要内容如下： 1．建立了TaqMan探针实时荧光定量PCR检测双歧杆菌和芽孢杆菌的方法，具有良好的特异性和敏感性，可对鸭消化道和呼吸道内的双歧杆菌和芽孢杆菌进行定量检测。 2．应用实时荧光定量PCR方法检测对照组2h、8h、24h、48h、72h、6d、12d、21d、36d时间段的鸭消化道和呼吸道内双歧杆菌、芽孢杆菌和肠球菌的含量，结果表明：食道和气管内双歧杆菌的含量(logcop／整段)分别为3.59～5.95、3.22～5.70，十二指肠、空肠、回肠、盲肠、直肠的含量(logcop／g)分别为5.94～7.64、6.30～8.95、6.16～8.02、7.51～9.40、5.37～8.58；食道和气管内芽孢杆菌的含量(logcop／整段)分别为4.24～6.52、3.91～6.26，十二指肠、空肠、回肠、盲肠、直肠的含量(logcop／g)分别为6.58～8.01、6.32～8.54、6.26～8.60、6.29～7.84、6.32～8.01；食道和气管内肠球菌的含量(logcop／整段)分别为3.52～6.08、4.42～7.06，十二指肠、空肠、回肠、盲肠、直肠的含量(logcop／g)分别为6.91～10.10、6.53～8.71、7.49～9.05、7.78～9.84、6.62～8.91。 3．应用实时荧光定量PCR方法检测鸭瘟弱毒经过不同途径免疫鸭后鸭的消化道和呼吸道内双歧杆菌、芽孢杆菌、肠球菌的含量，结果表明：口服、滴鼻和皮下免疫接种后，对免疫鸭消化道和呼吸道内双歧杆菌、芽孢杆菌和肠球菌有不同程度的影响，表现为免疫鸭消化道和呼吸道内双歧杆菌、芽孢杆菌和肠球菌在一些时间段的含量比对照组的增多10倍左右。 4．应用实时荧光定量PCR方法检测与鸭瘟弱毒经过不同途径免疫鸭同居组鸭的消化道和呼吸道内双歧杆菌、芽孢杆菌、肠球菌的含量，结果表明：口服免疫接种同居组鸭的消化道和呼吸道内双歧杆菌和芽孢杆菌的含量总体上与对照组的相近，滴鼻免疫接种同居组和皮下免疫接种同居组鸭的消化道和呼吸道内双歧杆菌、芽孢杆菌和肠球菌在一些时间段的含量比对照组的多10倍左右。