本文在新世纪经济全球化进程加快和马英九上台执政后两岸制度性协商形成的大背景下，从理论与实证的角度对两岸共同市场建设进行研究和探讨，从而为两岸共同市场的建设提供理论指导和实践参考。 首先，提炼出海峡两岸区域整合概念和两岸区域经济整合理论体系的三个基点：政治和解、两会协商和经贸交流，并在三个基点的基础上构建了两岸经济整合理论体系。通过分析两岸经济整合的纵向历史演变和横向现实特点，得出建立两岸共同市场是两岸经济整合的最佳模式和目标愿景。 其次，分析了世界经济全球化和区域经济一体化迅猛发展的背景下两岸经济整合的必然性和可能性，重点分析了马英九上台执政后两岸共同市场建设的时机和条件、政治前提、政治基础和前提条件以及影响两岸共同市场建设的障碍和困难；比较国外各种特色的共同市场，如欧盟、北美自由贸易区、东盟、10+1、10+3等一体化模式和特点，及其对两岸共同市场的经验借鉴，从而为两岸共同市场的建设提供可借鉴的“参照系”和构建模式。 再次，运用引力模型、边界效应模型的实证方法，测度和分析了两岸经济一体化推进的水平及未来发展趋势；构建了中美台日政治和经济互动中两岸经济整合的博弈模型；借鉴局部均衡和一般均衡分析方法对两岸自由贸易区的贸易效应和福利变化进行测度和评估；运用CGE——GTAP模型量化分析了两岸共同市场建设对两岸和全球主要经济体的经济福利效应。 然后，在以上理论和实证分析的基础上，明确了构建两岸共同市场的目标定位，提出了两岸共同市场建设的实施步骤和策略选择。 最后，提议构建闽粤台“两岸三地”紧密合作区，为两岸共同市场建设提供先行先试的经验积累和方法参考。