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目的：应用基因芯片筛选食管鳞状细胞癌相关差异表达基因，并探讨在基因芯片中明显表达上调基因金属基质蛋白酶-1和血管内皮生长因子-C的表达及其与临床病理参数的关系。 方法：1、应用基因芯片技术筛选与鳞状细胞癌发生相关的差异基因的表达。提取人食管癌及癌旁正常上皮组织的mRNA，逆转录为cDNA，Cy3-dUTP标记正常食管上皮组织， Cy5-dUTP标记食管鳞癌组织，制成探针与基因芯片进行杂交，经扫描仪扫描后，对获取的信号经相关软件分析、对比，筛选出差异表达的基因。2、挑选芯片中表达差异明显的两个基因MMP-1、VEGF-C，应用real time–PCR技术对14例食管鳞状细胞癌组织及癌旁正常上皮组织进行目的基因检测，从基因水平检测基因芯片的可靠性。3、应用免疫组化技术检测MMP-1、VEGF-C的表达情况，从蛋白水平检测基因芯片的可靠性，并分析其与食管鳞状细胞癌发生、发展、生物学行为及预后的关系。 结果：1、基因芯片技术检测四例食管鳞状细胞癌及癌旁正常上皮的基因表达，发现MMP-1及VEGF-C表达上调（Ratio值＞2），MMP-1在四例样本中的Ratio值分别为79.22、78.57、40.8、41.88；VEGF-C的分别为10.06、2.83、4.358、3.998。2、应用real time–PCR技术对14例食管鳞状细胞癌组织及癌旁正常组织中候选基因中2条目的基因进行扩增，发现其表达趋势均与芯片结果一致。3、应用免疫组化技术检测MMP-1、VEGF-C蛋白水平的表达情况，在90例癌组织、28例癌旁正常上皮组织、16例重度不典型增生/原位癌中，MMP-1、VEGF-C在食管鳞状细胞癌中的表达阳性率分别为81.11％、83.33%，均明显高于正常上皮组织及重度不典型增生/原位癌组织（p＜0.01）；MMP-1的表达与浸润深度、淋巴结转移以及临床分期均有一定关系，而与分化程度无明显相关性（p＞0.05）。VEGF-C的表达与淋巴结转移及临床分期均有一定关系（p＜0.05），而与分化程度及浸润深度均无明显关系（p＞0.05）。两者呈正相关关系性（p＜0.01）。 结论： 1、利用基因芯片技术可以筛选出与食管癌发生、发展相关基因的改变。经验证基因芯片可以作为一种可靠的实验方法应用于食管癌研究的各个领域。 2、MMP-1在食管鳞癌中表达上调，与癌组织浸润深度、淋巴结转移及临床分期均有一定关系，可作为食管鳞癌浸润、转移、判断预后的重要标记。 3、VEGF-C在食管鳞癌中表达上调，与癌组织淋巴结转移、临床分期均有一定关系，可作为判断食管鳞癌淋巴结转移及判断预后的标记。 4、MMP-1与 VEGF-C两者的表达具有正相关关系性，相互协调共同促进了食管癌的浸润、转移，二者结合可作为判断食管鳞状细胞癌生物学行为的重要参考指标。