GTEx项目即基因型-组织表达项目,该项目为科学界建立资源数据库和相关组织库,以研究人类组织中遗传变异和基因表达之间的关系。该项目的存在使研究者更多的能关注组织上基因的特殊性和共有性,发掘组织上基因与研究者研究重点的关系,因此为研究和分析人体组织提供了便利。加权基因共表达网络分析方法是在生物学数据研究中最被大家使用和接受的网络研究方法。常被用来探索某种疾病和基因的关系,从而进行致病基因的判断,药物的研究等。然而,现有的大多数研究仅关注一种共表达网络或在两种条件下比较两种基因共表达网络(例如,疾病与正常或人与小鼠的比较)。系统性地对人体组织的共表达网络和模块进行比较或多或少被忽略。比较组织特异性共表达网络对于评估组织异质性至关重要,这对组织特异性疾病研究和药物设计至关重要。因此,本课题通过使用GTEx项目提供的52种人体组织数据,使用WGCNA方法建立各个组织的基因共表达网络。之后利用假设检验方法对组织间相关性进行研究,并发现最相似组织。之后利用GO分析对组织网络的功能进行分析,并发现组织间共有功能,同时分析免疫及炎症相关功能的富集情况。实验结果显示52个组织之间都具有相关性。然而,组织之间的相似性水平是不同的,物理位置邻近的组织在它们的共表达网络中似乎更相似。例如,两个位置相邻的组织输卵管和膀胱在所有组织对中假设检验值最接近于0。同时,基本所有组织都具有免疫功能。但是在有些组织中存在免疫高度富集的模块,如肝脏,肾皮质,肺,子宫,脂肪皮下,脂肪内脏网膜等。本文系统地对人体组织的基因共表达网络进行研究和分析,相信该研究会对日后关于组织方面更深层的研究提供基础。