目的:越来越多的研究表明,RAB3GAP1在具有多种神经生物学功能和过程的大脑疾病过程中被修饰,并且是一个潜在的重要靶点。然而,对于RAB3GAP1的异常表达所引起的细胞水平和分子水平的变化尚不完全清楚。为了更深入地了解Rab3GAP1可能作为重要的疾病靶点的调控机制,我们对Rab3GAP1失调引起的蛋白表达变化进行了全面的研究。方法:首先通过慢病毒质粒转染小鼠神经元细胞构建小鼠皮质神经元RAB3GAP1过表达或者干扰细胞系。然后我们利用基于与生物信息学分析结合的i TRAQ（isobaric tag for relative and absolute quantitation）定量蛋白质组学方法进行组间交叉比较,发现了一些RAB3GAP1直接调控的候选靶蛋白。进一步的平行反应监测（parallel reaction monitoring,PRM）分析深入的探讨了RAB3GAP1表达异常对小鼠皮质神经元蛋白质组的影响。结果:与干扰对照组相比,RAB3GAP1干扰组中共鉴定到364个差异蛋白;与过表达对照组相比,RAB3GAP1过表达组中鉴定出了314个差异蛋白。生物信息学分析结果表明,RAB3GAP1干扰和过表达诱导产生的蛋白质组功能表达谱不同,暗示了其生物学过程和产生的细胞效应存在的潜在差异。组间交叉比较发现了一些RAB3GAP1直接调控的候选靶蛋白,平行反应监测（parallel reaction monitoring,PRM）分析表明,Sub1、Ssrp1和Top1蛋白可能在RAB3GAP1介导的皮质神经元自噬通路中发挥新的重要作用。结论:Sub1、Ssrp1和Top1可能是皮质神经元中RAB3GAP1介导的自噬通路中的一些新的潜在的重要中间蛋白。此外,本研究还发现Krt77作为细胞骨架蛋白的表达水平与RAB3GAP1的表达异常密切相关。根据结果可以推测Krt77蛋白可能参与了RAB3GAP1调控的轴突转运过程。然而,相关的分子机制,特别是基于RAB3GAP1的神经元自噬的分子机制需要进一步的研究。