采用ISSR分子标记对鄱阳湖具刚毛荸荠(Heleocharis valleculosa f.setosa)居群的遗传多样性水平、克隆多样性、克隆空间结构进行分析检测，并对其遗传变异的分布进行空间自相关分析。　　 使用5条ISSR引物，对象湖和大湖池居群中共120个个体遗传变异的空间分布和克隆结构进行研究。通过5条引物扩增所产生的49个多态位点，测定了鄱阳湖具刚毛荸荠居群的空间自相关系数Morans，值。空间自相关分析结果表明：在3 m的采样间隔尺度上，两个具刚毛荸荠居群均为缺乏空间结构的随机居群。具刚毛荸荠的克隆多样性很高(D=0.9975)，两居群间的克隆分化大，不具有共同的基因型。克隆构型为游击型，象湖居群克隆距离(6.7～24.7 m)大于大湖池居群(3.0～15.0m)。　　 使用8条ISSR引物，对具刚毛荸荠的4个地上居群及其种子库(4个)的遗传多样性水平及居群遗传结构进行分析。8条引物共扩增出133个位点，其中83个为多态位点，占62.41％。具刚毛荸荠具有较高的遗传多样性(在物种水平上，Nei’s基因多样性指数H=0.1649，Shannon信息指数I=0.2559)；地上居群的遗传多样性高于种子库，但种子库中含有2个地上居群没有的多态位点。各居群间的遗传分化很小(GST=0.0758)，基因流大(Nm=6.0920)。