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中国沿海相手蟹科（Sesarmidae）蟹类的分类问题较多,为厘清其种类乃至属间的系统关系,特运用线粒体DNA的COI和16S r RNA基因对中国沿海相手蟹进行了分子系统分析;以线粒体COI基因作为分子标记,针对中国沿海红树林中的两种重要蟹类即弧边招潮（Uca arcuata）和近亲拟相手蟹（Parasesarma affine）的不同地理群体,对它们的群体遗传结构、系统地理格局及幼体扩散对其遗传结构的影响进行系统分析,从而了解现有种群分布格局形成的历史原因和演化过程,比较种间进化历程的异同,探讨更新世冰期地质和气候对其种群进化历史的影响,进而阐明历史因素、环境因素及蟹类自身生态习性对其群体遗传结构和系统地理分布模式的影响规律。主要结果如下:相手蟹科的诸多种类因其形态极其相似成为方蟹总科（Grapsoidea）分类中疑问较多的一个类群。对中国沿海相手蟹线粒体COI和16S r RNA基因序列进行分子系统发育分析的结果表明,14种相手蟹COI和16S r RNA基因序列之间差异分别为5.7%～14.5%和1.5%～12.1%,均达到了种间差异水平;构建的系统发育树显示,14种相手蟹分别为独立有效物种,但分属于拟相手蟹属（Parasesarma）和近相手蟹属（Perisesarma）的4种拟相手蟹和3种近相手蟹没有分别形成2个独立的支系,而是混合聚成1大支系;而属于螳臂相手蟹属（Chiromantes）的无齿螳臂相手蟹（C.dehaani）则首先与属于中相手蟹属（Sesarmops）的中华中相手蟹（S.sinensis）聚成1支,再与红螯螳臂相手蟹（C.haematocheir）聚为1大支,表现出与形态分类的不一致;错综复杂的分子系统关系预示着相手蟹类为多系起源,也表明它们之间的种间关系乃至于属间关系尚有诸多问题有待进一步厘定。弧边招潮14个群体293个个体的线粒体COI基因片段序列长度为642bp,共有121个单倍型,群体的单倍型多样度（h）和平均核苷酸多样度（π）分别为0.8879±0.1045和0.0428±0.0234,表现为弧边招潮具有高水平的遗传多样性。单倍型邻接关系树和单倍型网络关系图显示,弧边招潮在黄海、东海和南海分布范围内分化出A和B两个单倍型世系,世系A的95个单倍型除1个单倍型外其余94个全部分布于东海和南海,而世系B的单倍型则黄海、东海和南海均有分布,世系A和世系B的分化时间大约在50.4万年前。AMOVA分析和FST值分析结果表明,弧边招潮群体在分布范围内存在着一定的遗传分化,但黄海组群和东海-南海组群之间的遗传差异非常明显,显示两组群之间存在显著的遗传分化,形成了显著的遗传结构;这可能与弧边招潮的幼体具有喜欢高盐水域和喜欢停留在其原栖息地潮滩的生活习性以及黄海与东海-南海组群间存在长江冲淡水所形成的地理屏障有关。中性检验与核苷酸不配对分布的研究结果揭示,弧边招潮世系A和世系B均经历了明显的群体扩张。近亲拟相手蟹12个群体222个个体的线粒体COI基因片段序列长度为612bp,共有40个单倍型,群体单倍型多样度为0.5089±0.0419,平均核苷酸多样度为0.0203±0.0171,表现为中等水平的遗传多样性。单倍型邻接关系树的拓扑结构显示近亲拟相手蟹群体没有分化出来明显的单倍型类群,尚未形成显著的分支谱系;单倍型的网络关系图呈现出明显的星状结构,即以主体单倍型为中心,其余单倍型呈星状排列在其周围。AMOVA分析（遗传变异主要来自群体内而非群体间）和FST值分析(两两群体间的FST值统计检验都不显著)结果表明,近亲拟相手蟹群体在分布范围内没有显著的遗传结构,不存在地理隔离模式,群体间的遗传分化水平较低。核苷酸不配对分布和中性检验结果表明,近亲拟相手蟹大约在51 000年前经历了群体扩张事件。