本研究旨在探讨补饲开食料对牦牛犊牛免疫器官发育及其机能的影响。选取出生日龄与体重相近、健康的1月龄大通牦牛犊牛（公）20头,随机等分为两组（n=10）,对照组（C）犊牛饲喂代乳粉和苜蓿干草,补饲组（S）犊牛在C组的基础上补饲开食料,两组固体物质的干物质饲喂量保持一致,试验犊牛均单栏饲养,自由饮水。牦牛犊牛干物质采食量达到1 kg/d时,每组各屠宰5头,采集肝脏、胸腺和脾脏,观察组织形态,测定各器官分泌的激素和细胞因子含量,并进一步采用基于LC-MS的肝脏代谢组学技术,分析肝脏中的代谢产物。利用RNA-Seq技术分析两组牦牛犊牛肝脏、胸腺和脾脏的差异表达基因,然后通过GO得到差异基因进行功能注释,用KEGG进行通路富集分析来研究补饲开食料对犊牛免疫器官功能的影响。主要研究结果如下:（1）60～180日龄平均每天给牦牛犊牛补饲331.35 g开食料,S组较C组平均日采食量提高了8.88%,S组平均日增重为0.48 kg,S组胸腺器官指数较C组提高了57%。S组血液中Ig G、Ig M、Ig A、IL-2、IL-4、IL-6、M-CSF、IFN-β、IFN-γ和TNF-α免疫因子含量显著高于C组（P＜0.05）。补饲开食料提高了牦牛犊牛的生长性能和血清免疫因子的含量,从而正向调控了牦牛犊牛的机体免疫能力。（2）补饲开食料促进牦牛犊牛肝细胞的发育;S组犊牛肝脏IFN-γ含量显著高于C组（P＜0.05）;两组牦牛犊牛肝脏共筛选出149个差异代谢物,其中上调表达的差异代谢物有56个,下调表达的差异代谢物有93个,分析发现差异代谢物主要是脂质和类脂分子、有机酸及其衍生物和核苷、核苷酸和类似物;两组牦牛犊牛肝脏对比有1003个差异基因,其中有568个是上调基因,435个是下调基因。差异基因主要参与氧化磷酸化、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢、淀粉和蔗糖代谢等路径。补饲开食料增强肝脏对碳水化合物、脂肪和氨基酸的代谢,且主要通过促进氨基酸代谢来增强肝脏的抗氧化功能和免疫功能,正向调控牦牛犊牛的肝脏发育和免疫功能。（3）S组牦牛犊牛胸腺皮质厚度和胸腺肽含量显著高于C组（P＜0.05）,胸腺细胞因子含量差异不显著（P＞0.05）。转录组学分析发现两组牦牛犊牛胸腺对比有2004个差异基因,其中有793个是上调基因,1211个是下调基因,且主要通过下调TLR2、TLR4、ECM和PI3K等基因依赖的PI3K-Akt信号通路和上调TNF-α、LBP、TCR、ELC和ICAM等基因依赖的NF-κB信号通路来实现增强胸腺免疫功能的调节作用。（4）S组牦牛犊牛脾脏脾小结半径显著大于C组（P＜0.05）,IFN-γ等细胞因子含量显著高于C组（P＜0.05）。两组牦牛犊牛脾脏对比有772个差异基因,其中有389个是上调基因,383个是下调基因,且主要通过上调FI、C1qrs、C1INH（SERPING1）、C3AR1、VWF、MCP、F13和FGB等基因依赖的补体和凝血级联和上调HSP70、CD8A、CD8B、102272312、102278697和102273821等基因依赖的抗原处理和呈递等信号通路来实现提高脾脏的免疫功能的调节作用。综合得出,补饲开食料能增加牦牛犊牛的营养摄入水平,提高了其生长性能和血液中免疫因子含量;补饲开食料使牦牛犊牛肝脏的氨基酸代谢增强,进而促进其肝脏形态和功能的良好发育,甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢可能是建立营养与免疫的关键氨基酸信号通路。补饲开食料能促进牦牛犊牛胸腺的发育和细胞因子的分泌,主要通过下调PI3K-Akt信号通路和上调NF-κB信号通路来增强胸腺的免疫功能;同时,补饲开食料也促进了牦牛犊牛脾脏的发育和细胞因子的分泌,主要通过上调补体和凝血级联、抗原处理和呈递等通路来增强脾脏的免疫功能,建议给哺乳期牦牛犊牛进行适量的开食料补饲,不仅能提高其生长性能表现,还能促进其免疫器官形态和功能发育,从而更有利牦牛犊牛的早期健康生长。