江西地区CRAB的耐药和临床感染的分子流行病学研究

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目的:收集江西省11家地区代表性医院临床分离的CRAB菌株,分析全省CRAB的感染情况、耐药特点、耐药机制、主要的流行型别以及影响CRAB感染的预后危险因素,为CRAB菌株的感染、播散和诊治提供参考依据。方法:(1)收集2017年3月至2018年6月江西省11家地区代表性三级甲等综合性医院临床分离的CRAB菌株,同一患者的重复菌株仅留取首次送检菌株,菌株送检标本来源于痰液、分泌物、血液等10种标本类型,菌株患者来源于ICU、神经科、呼吸科等17个科室。(2)运用体外药物敏感性实验分析CRAB的耐药情况,聚合酶链式反应(PCR)检测CRAB携带耐药基因的情况,并比较不同区域在菌株耐药情况和耐药基因携带情况上的差异。(3)选用结晶紫染色法检测CRAB的生物膜形成能力,脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)分析菌株间的亲缘关系,并比较不同地区间生物膜形成能力和CRAB克隆多态性的差异。(4)依据CRAB感染患者入院30天后的生存状况将其划分为生存组和死亡组,通过单因素分析和多因素Logistic回归分析研究影响CRAB感染预后的危险因素。结果:(1)本研究共纳入184株非重复的CRAB菌株,CRAB感染患者平均年龄为(61.99±19.56)岁,其中男性136例(73.91%)。分离的CRAB主要来源于ICU(32.06%)和神经科(16.85%),送检标本的来源主要为痰液(48.37%)和伤口分泌物(16.85%)。(2)184株菌对氨苄西林、氨曲南、哌拉西林、头孢曲松、头孢唑林耐药率均为100%,头孢哌酮舒巴坦耐药率为69.00%,复方新诺明的耐药率为83.7%,其他药物耐药率均高于85%,未发现对米诺环素耐药的CRAB菌株。不同地区间复方新诺明、头孢哌酮舒巴坦和左氧氟沙星的耐药率差异具有统计学意义,不同年龄段间妥布霉素的耐药率差异具有统计学意义,不同性别间环丙沙星和复方新诺明的耐药率差异具有统计学意义。(3)184株CRAB菌株均携带OXA-51基因,148(80.4%)株菌携带OXA-23基因,5株菌携带NDM基因,1株菌携带KPC基因,未检测出OXA-24、OXA-58、VIM、IMP基因。(4)PFGE结果显示,184株CRAB可分为25个聚类组,A和B聚类组是主要的聚类组,分别占比33.7%和28.8%,MLST分析结果将184株CRAB分为14个不同序列型(ST型),ST 829,ST new1,ST 1417为优势序列型,分别含有CRAB菌株56株、49株和30株,其他11个序列型含有1-10株CRAB菌株不等,零散分布在江西各地,ST 829序列型(Χ~2=10.461,Ρ=0.033)和ST 1417(Χ~2=10.116,Ρ=0.039)在各地区间的分布差异具有统计学意义。生物膜形成能力结果显示184株CRAB菌株中87株具有生物膜形成能力,其中77株是弱阳性,8株中等阳性,2株强阳性。(5)CRAB感染患者的预后因素分析中,单因素分析结果显示患者入院前患有糖尿病,治疗期间入住ICU和使用呼吸机治疗的差异具有统计学意义,但多因素分析未发现具有统计学意义的独立危险因素。结论:(1)本研究中所有CRAB菌株对米诺环素均无耐药性,但对其它抗菌药物均有不同程度的耐药,且从总体来看耐药形势比较严峻。(2)本研究中80.4%CRAB株菌携带OXA-23基因,这可能是菌株对碳青霉烯类药物产生耐药性的主要原因之一。(3)本研究中ST 829,ST new1,ST 1417为CRAB的优势序列型,且ST 829和ST 1417在地区间的分布差异具有统计学意义。(4)本文所纳入的研究因素中,未发现影响CRAB感染患者预后的独立危险因素,这有待更深更广层面的研究验证。
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