线粒体基因组分析揭示中国野桑蚕北方和南方群体间存在显著遗传分化

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养蚕缫丝(家蚕)是古代中国的伟大发明,为人类文明做出了重大贡献。经过近200年的科学探索,家蚕起源于中国和家蚕的野生祖先来源于中国野桑蚕已成定论;但家蚕在中国具体或大致的起源地仍存在争论,尤其是缺乏遗传学证据。线粒体基因组是研究家养动物起源与分化的理想标记。因此,本论文从线粒体基因组的角度对中国野桑蚕的北方和南方群体的遗传分化进行了初步研究,并对家蚕的起源进行了探讨。论文测定了中国北方地区的沈阳野桑蚕的线粒体基因组,对现有58个野桑蚕和家蚕的线粒体基因组序列进行了比较分析,初步探讨了中国北方野桑蚕(3个序列)、中国南方野桑蚕、日本野桑蚕和家蚕的系统进化关系。论文还利用CytB基因序列探讨了中国野桑蚕北方和南方群体之间的遗传分化程度。主要结果如下:1.论文报道了沈阳野桑蚕的线粒体基因组。沈阳野桑蚕线粒体基因组全长15,682bp,包括13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个AT富集区(491bp)。该基因组的基因组成和排列顺序与已知的其他野桑蚕和家蚕的线粒体基因组一致。该基因组是继青州野桑蚕之后的第2个北方野桑蚕的线粒体基因组。2.线粒体基因组分析发现中国野桑蚕的北方与南方群体间存在明显分化。通过对现有58个野桑蚕和家蚕线粒体基因组序列的比较,定义了4个单倍型类群,即家蚕(41个序列)、日本野桑蚕(2个序列)、中国南方野桑蚕(12个序列)和中国北方野桑蚕(3个序列)。4个单倍型类群间的线粒体基因组表现出显著的序列差异,但同一类群内的序列具有高度的相似性。3.线粒体基因组系统发育分析揭示了家蚕的直接野生祖先来源于中国野桑蚕的北方群体。在基于线粒体基因组序列的进化树中,家蚕与中国北方野桑蚕的亲缘关系最为密切。这一结果表明,家蚕的直接野生祖先来自中国北方野桑蚕,而不是广为研究的中国南方野桑蚕。4.基于CytB基因序列的分析确认了中国野桑蚕的北方和南方群体间存在显著的地理遗传结构。22个中国野桑蚕的CytB基因序列(北方群体10个、南方群体12个)共鉴定了19种单倍型,群体间的遗传差异(84.95%)显著大于群体内的遗传差异(15.05%)。系统发育及单倍型Network分析均表明,中国野桑蚕的北方和南方群体间已形成明显的地理遗传结构。论文发现了中国野桑蚕的北方群体和南方群体之间存在显著遗传分化,且揭示了中国北方野桑蚕才是家蚕的直接野生祖先,为深入研究家蚕起源与分化提供了新的见解。
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