我国是一个农村人口居多、经济发展均衡的国家。农业,农村和农民的“三农”问题始终是制约我国建设全面小康社会的重要因素。当前,农村社会保障问题将直接关系到农村改革的进一步深化与农村经济的健康、可持续发展,甚至于整个国民经济的协调发展和社会的长治久安。新型农村合作医疗制度作为我国现阶段农村居民的基本医疗制度,它在确保广大农民获得基本医疗服务,减轻农民疾病上的经济负担,提高农民的整体健康水平等方面发挥着及其重要的作用。尽管,我国的新型农村合作医疗制度在经过几年的运行之后,已积累了不少经验,也取得了许多成果,但同时也遇到不少阻碍因素,使新农合在未来的可持续发展道路上可能会遇到许多困难。新型农村合作医疗保险基金的筹资问题、统筹管理问题、补偿支付问题等难点将直接威胁着新型农村合作医疗制度的可持续发展。因此,重点研究新型农村合作医疗可持续发展过程中遇到这些难点问题必将对新型农村合作医疗制度的可持续发展具有重大的理论与实践意义。本文通过阐述我国新农合制度的演进和发展历史,进而在分析我国新农合当前发展道路上出现的问题及原因的基础上,重点分析和阐述了新农合可持续发展中的难点问题。主要从新农合的筹资问题、政府政策实施及法律规范问题、统筹管理问题和医疗卫生机构服务质量问题灯四个大的方面深入细致地探讨了新农合可持续发展的难点所在。并建议从创建多元化筹资渠道、完善各级政府新农合绩效考评机制、提高统筹层次、提高农村基层医疗机构服务水平等多方面着手解决这些难点问题。