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本文建立了一种用于分子对接和虚拟筛选的新方法：SHEF(SphericalHarmoniccoEfficientFilter)。这种方法利用球谐函数计算模拟分子表面，并将相应的球谐函数扩展系数作为分子表面描述符，来完成分子对接与虚拟筛选。进行了配体与受体空腔之间的分子对接测试以验证SHEF方法在分子对接中的效果，结果表明SHEF方法进行分子对接可以得到令人满意的结果。利用SHEF方法对柔性小分子活性构象进行筛选以判断其识别能力。测试了SHEF方法对于小分子数据库的基于互补性/相似性的虚拟筛选的效果及效率。