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针对近些年我国肾综合征出血热疫情发展趋势，本研究在东北(黑龙江、吉林)、华北(北京)、东南(浙江)、西南(贵州)、西北(新疆)不同类型的疫源地中选择代表性调查点，采用分子生物学检测技术和序列分析以及应用酶联免疫吸附试验(ELISA)对鼠类宿主动物和家畜汉坦病毒感染进行了调查。结果如下：(1)采集鼠类13种526只，总带毒率2.28％，各地阳性率差别无统计学意义(χ~2=7.238，P=0.204)；大林姬鼠、黑线姬鼠、褐家鼠、棕背鼠平感染率分别为3.81％、1.41％、4.35％、4.08％，其余鼠种均阴性；(2)对上述鼠阳性代表性标本进行汉坦病毒的分型研究和M、S基因序列测定分析表明：目前我国流行的汉坦病毒仍然以Hantaan virus(HTNV)和Seoul virus(SEOV)为主；并首次从我国大林姬鼠中发现Amur汉坦病毒的存在；在贵州褐家鼠中发现了汉滩型汉坦病毒感染。(3)猪、牛、羊血清中汉坦病毒抗体检测阳性率分别为3.39％、1.74％和1.39％，证实汉坦病毒在家畜中的感染普遍存在。综上所述，本研究进一步证实我国鼠类宿主动物携带了多种型别的汉坦病毒；揭示了褐家鼠作为汉滩型汉坦病毒溢出宿主的可能性；并首次发现我国大林姬鼠携带Amur汉坦病毒；同时进一步证实了汉坦病毒在家畜中普遍感染，但鉴于其感染率偏低，其在传播HFRS上的作用有待进一步研究。