近年来,高通量测序技术的快速发展在表观遗传方面产生了海量的数据,这些大数据隐含了很多表观修饰的生物学功能,如何去揭示表观修饰的生物学功能迫切地需要我们这些生物信息工作者的参与。此外,组蛋白修饰作为最重要的表观修饰之一,它不仅与基因表达有一定的关系,而且对于癌症的发生也有关键的调节作用。因此,了解组蛋白修饰对癌症发生的调控机制和对癌症的治疗都有一定的帮助。本论文选用了人类血液组织中正常细胞系GM12878和血液组织中癌变细胞系K562作为研究对象;在GM12878细胞系和K562细胞系里分别计算了癌基因的表达值与11种组蛋白修饰之间的Spearman相关性大小;在K562中对多种组蛋白修饰进行聚类分析,构造了血癌中癌基因的组蛋白修饰簇;建立了K562中癌基因的11种组蛋白修饰的偏相关网络图;在DAVID数据库中对血癌中的癌基因作了GO功能和KEGG通路分析。文中详细的研究内容如下:1.研究了启动子区域11种组蛋白修饰在癌基因上的分布情况。结果表明,不同组蛋白修饰在基因启动子区域里偏好的位置也是不同的,有些组蛋白修饰会出现在转录起始位点(TSS)附近的两端,有些组蛋白修饰会出现在转录起始位点下游的位置,还有一部分在启动子区域很少出现。2.计算了组蛋白修饰与基因表达之间的Spearman相关性,找出了调控血癌发生的4种重要组蛋白修饰分别是H3K9ac、H3K27ac、H3K79me2和H3K36me3。从多元线性回归的理论中也得到了这4种组蛋白修饰在血癌中调控的重要性。3.重新筛选癌基因,在K562中构造了与癌基因有关的组蛋白修饰偏相关网络图。对多种组蛋白修饰作了聚类分析,发现了原癌基因中有两个关联性很强的组蛋白修饰簇(H3K4me3、H3K4me2、H3K79me2、H3K9ac、H3K27ac)和(H3K4me1、H3K36me3),而在抑癌基因中有1个关联性很强的组蛋白修饰簇(H3K4me2、H3K4me3、H2az、H3K9ac、H3K27ac、H3K79me2、H3K4me1)。4.在DAVID数据库中对癌基因作了GO功能和KEGG通路分析,再与超级增强子调控的细胞身份基因取交集,得到了调控血癌发生的4个关键原癌基因FOXL2、GATA1、LYL1和TRIM24;调控血癌发生的1个关键抑癌基因PTEN。