应用iTRAQ技术对维汉T1DM患者血清差异表达蛋白的研究

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目的:比较维吾尔族和汉族1型糖尿病(T1DM)病人与正常人血清差异表达蛋白质,筛选出与T1DM密切相关的特异性差异表达蛋白,为寻找特殊生物标志物提供靶标。并从蛋白质组学角度为探讨T1DM发病机制提供参考依据。方法:收集维吾尔族和汉族T1DM病人血清各20例,维吾尔族和汉族正常人血清各20例;拟比较汉族T1DM病人与汉族正常人,维吾尔族T1DM病人与维吾尔族正常人,汉族T1DM病人与维吾尔族T1DM病人,汉族正常人与维吾尔族正常人,汉族和维族T1DM病人与汉族和维族正常人的差异表达蛋白。提取所有研究对象的血清蛋白质,运用8标iTRAQ技术标记蛋白,采用岛津的LC-20AB液相系统对样品进行液相分离,通过LC-ESI-MSMS分析肽段,用IQuant软件对蛋白质进行鉴定和定量分析,筛选各组的差异表达蛋白,最后对获得的差异表达蛋白进行GO和pathway富集分析。结果:1.汉族病人与汉族正常人血清蛋白质的比较,筛选出509个差异表达蛋白,其中319个蛋白表达上调,190个蛋白表达下调;通过GO富集分析发现,差异蛋白的功能为GTP结合,鸟嘌呤核苷酸结合,焦磷酸酶活性,水解酶活性等;通过pathway富集分析发现,差异显著蛋白与生物粘附,血小板活化,丙酮酸盐代谢等代谢通路有关;2.维族病人与维族正常人血清蛋白质的比较,筛选出469个差异表达蛋白,其中287个蛋白表达上调,182个蛋白表达下调;通过GO富集分析发现,差异蛋白的功能为丝氨酸内肽酶活性,丝氨酸内肽酶抑制剂的活性,内肽酶活性的调节,内肽酶抑制剂的活性等;通过pathway富集分析发现,差异显著蛋白与补体和凝血级联,ECM受体相互作用,细胞粘附分子等通路有关;3.汉族病人与维族病人血清蛋白质的比较,筛选出354个差异表达蛋白,其中180个蛋白表达上调,174个蛋白表达下调;通过GO富集分析发现,差异蛋白的功能为金属离子结合,阳离子结合,核酸内切酶活性,核糖或脱氧核糖核酸活性等;通过pathway富集分析发现,差异显著蛋白与补体和凝血级联,氧化磷酸化等通路有关;4.汉族正常与维族正常人血清蛋白质的比较,筛选出425个差异表达蛋白,其中223个蛋白表达上调,202个蛋白表达下调;通过GO富集分析发现,差异蛋白的功能为铁离子结合、血红素结合、丝氨酸内肽酶抑制剂的活性等;通过pathway富集分析发现,显著蛋白在补体和凝血级联、酪氨酸代谢等通路有关;5.汉族和维族病人与汉族和维族正常人血清蛋白质的比较,筛选出612个差异表达蛋白,其中461个蛋白表达上调,151个蛋白表达下调;通过GO富集分析发现,差异蛋白的功能为离子结合,鸟嘌呤核苷酸结合、GTP结合、酶结合等;通过pathway富集分析发现,差异显著蛋白与生物黏附、肌动蛋白细胞骨架调控、白细胞跨内皮迁移、血小板活化,ECM受体相互作用等通路有关。结论:1.共鉴定出1174个蛋白,重复率为65.5%;2.差异蛋白的功能主要以结合、催化活性为主,一部分参与结构分子活性、转运活性、受体活性等;差异蛋白中参与的代谢途径、补体和凝血级联、PI3K-Akt信号通路、吞噬、生物粘附等通路与T1DM密切相关;3.为进一步确定与T1DM相关的特异性差异表达蛋白质生物标志物,需进一步利用MRM技术,对筛选出的目标蛋白进行验证。
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