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二氧化硫(SO2)作为一种常见的大气污染物，对于生物有很大的危害作用。SO2能影响植物的正常生理活动，高浓度的SO2能造成植物叶片失绿或坏死，抑制细胞分裂，甚至导致部分细胞死亡。目前，植物抵御SO2胁迫的分子机制还不清楚。 本文以拟南芥(Arabidopsis thaliana.L)为研究对象，以拟南芥基因表达谱的分析结果为基础，应用甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术分析了30mg·m-3SO2胁迫3d对拟南芥基因组DNA甲基化多态性的影响。结果表明，选用EcoRⅠ和HpaⅡ/MspⅠ的13对引物组合共扩增出760条带，得到的带型包括非甲基化、半甲基化和完全甲基化三种类型。对照组和SO2胁迫处理组中非甲基化（Ⅰ型带）位点数最多，分别占总甲基化多态性扩增位点数的55.66％和53.29％，半甲基化（Ⅲ型带）率分别为18.02％和11.05％，全甲基化(Ⅱ和Ⅳ型带)率分别为26.32％和35.66％，甲基化敏感扩增多态性(MSAP)比率分别为44.34％和46.71％。SO2胁迫后没有发生变化的条带是409条，即甲基化状态未变化类型的位点数占总扩增位点数的53.82％。SO2胁迫后，拟南芥基因组甲基化多态性位点占总扩增位点数的46.18％，其中，发生甲基化的位点为220个，占总扩增位点数的28.95％;发生去甲基化的位点为131个，占总扩增位点数的17.23％。在所扩增出的位点中，发生甲基化的位点数高于去甲基化的位点数，且发生超甲基化的位点数（137个）要比重新甲基化的位点数(68个)多。研究结果表明，在SO2处理过程中拟南芥基因组DNA存在基于DNA甲基化水平和模式改变的表观遗传变异，甲基化变异模式以甲基化为主。 本文还采用甲基化敏感的限制性内切酶酶切-PCR法，检测了拟南芥SO2胁迫应答基因编码区5端第一个CCGG序列的胞嘧啶甲基化特征。结果表明，在检测的4个胁迫应答基因的特定序列中，对照和SO2熏气组中MHL1和NIT2基因编码区为全甲基化5mCCGG，MYB基因为半甲基化5mCCGG，SO2胁迫未引起检测位点甲基化状态的改变;但是，对照组拟南芥ACS6基因编码区中的非甲基化CCGG位点，在30mg·m-3SO2熏气组中变为半甲基化5mCCGG。研究结果表明，SO2胁迫能使植物基因编码区的胞嘧啶甲基化特征改变，可能对基因组稳定和基因转录调节具有作用。