胃癌中转录因子与miRNA共调控网络的构建及let-7i与其靶基因在胃癌侵袭转移中的作用

来源 :吉林大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaodixi000
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
胃癌是世界范围内常见的恶性肿瘤,其病死率仅次于肺癌位居恶性肿瘤第二,严重威胁了人们的生命。迄今为止,有70%以上的胃癌病例发生在发展中国家,在中国,胃癌的病死率占居各种恶性肿瘤中的首位。尽管目前早期胃癌的治疗已经取得了很大的进步,大大提升了患者的生存率,但对于处于晚期阶段的胃癌病例来说,其五年生存率仍然很低。这不仅仅由于早期胃癌的诊断率较低,还由于肿瘤细胞强大的增殖、侵袭、迁移能力。因此,进一步探究胃癌细胞浸润生长及胃癌发生转移的分子机制,筛选出胃癌治疗中的关键干预靶点,对于胃癌的预防和治疗都具有十分重要的意义。转录因子(Transcriptionfactor)是一类在转录过程中起到决定性作用的调控原件,通过特异性结合在基因特定序列上从而调控基因的转录。有很多转录因子在胃癌的发生、发展和转移过程中起到重要作用。microRNA(miRNA)是一类单链非编码小分子RNA,能够通过与目标mRNA结合而抑制其翻译或导致其降解。转录因子和miRNA各自参与调控了基因的转录水平以及转录后水平。与此同时,转录因子和miRNA之间也存在着共同调控的关系。它们之间的相互合作与相互调控形成了一个复杂的调控网络。目前,以转录因子和miRNA为核心建立调控网络已经成为一种分析生物调控机制的有效手段,这种方法为研究疾病发生的机理提供了重要的线索。miRNA的异常表达可以调控和影响细胞中基因的异常表达,继而促进肿瘤的发生。在第一部分研究中,应用80对Affymetrix外显子芯片筛选出胃癌组织中的差异基因表达谱,得到在胃癌组织中一共有2540个差异表达基因(foldchange>1.5),其中715个显著差异表达基因(foldchange>2),这些基因大多数在癌组织中为表达上调,只有约五分之一为表达下调。同时应用5对miRNA芯片筛选出胃癌中差异表达的miRNA,共得到93个显著差异表达的miRNA,其中27个呈现表达上调,66个呈现表达下调。对2540个差异表达基因做出详尽系统的基因功能分析和信号通路分析,而这些分析都为今后更加系统地研究胃癌相关基因以及这些差异基因如何参与胃癌的发生、参与了哪些关键的信号通路等奠定了坚实的基础。通过整理芯片数据并整合TRED、Targetscan等数据库中预测出的转录因子和miRNA靶基因的信息,建立了胃癌中转录因子和miRNA共调控网络,并对调控网中络的基因进行分析和注释。结果揭示了这些基因分别隶属于“细胞外基质-受体相互作用”和“焦点粘连”这两个信号通路,提示这些基因与肿瘤的浸润生长关系密切,可能是参与胃癌侵袭和转移过程的关键基因。通过对调控网中的关键基因进行节点分析,发现COL1A1和NCAM1这两个基因受到最多的调控关系,因此选取这两个基因进行着重研究。通过qRT-PCR和westernblot的实验手段分别在mRNA和蛋白水平上验证了COL1A1的过表达和NCAM1的低表达,与芯片和调控网的预测结果相符。从TF-miRNA共调控网络中可见,COL1A1受到了let-7i的直接调控作用。为了研究和证实let-7i在癌症发生中所发挥的生物学功能,通过qPCR和westernblot检测到胃癌组织及胃癌细胞中let-7i的显著低表达,且胃癌组织中let-7i的表达与患者肿瘤浸润和转移程度都具有一定相关性。选取胃癌细胞株SGC-7901和MGC-803进行后续试验,通过在细胞中转染let-7imimic,人为升高let-7i在细胞中的表达水平后,发现这两种胃癌细胞的增殖能力、迁移能力及侵袭能力都发生了显著降低;同时,通过建立裸鼠体内移植瘤模型进一步证实了过表达let-7i能够有效抑制肿瘤生长。为了验证let-7i是通过调控COL1A1的表达参与胃癌的发生发展,在胃癌细胞SGC-7901和MGC-803中转染let-7imimic后,检测到COL1A1的mRNA以及蛋白水平都发生了显著下调;通过荧光素酶活性实验进一步证实了let-7i通过靶向调节COL1A1的3’UTR区域参与调控COL1A1的表达。此外,通过在胃癌细胞内转染siRNA-COL1A1人为敲减COL1A1的表达之后,两种胃癌细胞的增殖、迁移及侵袭能力都发生了显著降低,这与人为提高细胞内let-7i表达后对胃癌细胞的作用结果一致。以上结果全部说明COL1A1就是let-7i的直接靶基因。综上所述,通过建立胃癌中TF-miRNA共调控网络,预测了let-7i与COL1A1的调控关系,并通过实验验证let-7i能够减弱胃癌细胞的增殖能力、抑制细胞的迁移和侵袭能力,并在体内抑制肿瘤的生长;减少COL1A1的表达能够抑制胃癌细胞的增殖能力并削减胃癌细胞迁移与侵袭能力。Let-7i是通过上调COL1A1的表达水平促进胃癌的发展进程。提示let-7i可能作为胃癌诊断、治疗的潜在靶点。
其他文献
乳腺癌是女性最普遍的恶性疾病。与世界其他大多数国家一样,乳腺癌也是中国女性最常见的癌症,2008年,中国乳腺癌新发病例和死亡病例分别占全世界的12.2%和9.6%;而造成90%实体
自1990年开始的全民教育,不仅是对人权理念的最好诠释,也是从教育的角度对人类命运最深切的关怀,它使各国能够在世界范围上比较自身教育的发展水平,同时最大程度地调动全球政
期刊
<正> 现代建筑的产生和发展,除了当时的经济发展,工业发展,市场状况影响建筑新的需求之外,建筑材料的发展是不容忽视的重要原因,特别是钢筋混凝土的广泛应用。混凝土在古罗马
目的:观察调神抑痛针刺法治疗卒中后由中枢性疼痛引起的肢体运动障碍临床疗效,为临床提供客观有效的方法和依据。方法:将120例卒中后中枢性疼痛患者随机分为调神抑痛组60例和
回 回 产卜爹仇贱回——回 日E回。”。回祖 一回“。回干 肉果幻中 N_。NH lP7-ewwe--一”$ MN。W;- __._——————》 砧叫]们羽 制作:陈恬’#陈川个美食 Back to yield
调查广东省1108名高职大学生,发现他们在生源地构成、家庭文化及父母职业等方面,具有典型的"弱势"性背景特征,这些特征又与当下高职大学生的思想政治发展状况有着密切的关联
"这个病人有点发热,淋巴细胞也升高了,这一点和新型冠状病毒肺炎症状也不吻合。""从症状来看,和新型冠状病毒感染引起的肺炎还有区别。""患者伴有咽痛、咳痰,新型冠状病毒感
回 回 产卜爹仇贱回——回 日E回。”。回祖 一回“。回干 肉果幻中 N_。NH lP7-ewwe--一”$ MN。W;- __._——————》 砧叫]们羽 制作:陈恬’#陈川个美食 Back to yield
研究背景 原发性肝癌是各类癌症细胞中恶性程度极高、且预后是最差的一类,俗称“癌中之王”。亚洲东南部、非洲肝癌发生率一直保持较高的水平,欧洲和美国肝癌发病率也一直较