“程序是法律的心脏”。由于立法技术的粗糙、社会的剧烈变革等因素的影响,程序更新的滞后,国家权力与公民权利失衡,导致程序失灵。程序失灵是指由于刑事诉讼程序规范自身的原因导致的在刑事司法活动中不能够有效公正地解决刑事纠纷。现代治理理论的勃兴以及治理理论的刑事司法的进入表明,程序急需治理。刑事诉讼的程序治理是在刑事诉讼利益相关者的共同参与下,对刑事诉讼程序及其制度环境进行宏观上的梳理、优化,使得程序有序、合理的动态过程。刑事诉讼程序治理表现出协调性、开放性和合目的性三种价值。协调性是指国家权力与公民权利的协调；开放性是指程序参与人的主体性和参与性；合目的性是指刑事诉讼程序结果符合以最小社会资源解决纠纷的功利性的目的。刑事诉讼程序治理是范畴与层次关于治理实践的两个维度。刑事诉讼程序治理的范畴包括刑事司法权的配置、刑事司法组织的配置、司法参与人的权益保障和刑事司法程序安定性和救济性的统一；刑事诉讼程序治理的层次依治理的对象可分为刑事诉讼程序规范的治理和程序环境的治理。我国的刑事诉讼程序治理实践可分为确立程序治理理念、明确治理主体和丰富治理手段三个方面。程序治理理念是指有利于诉讼参与人原则；治理主体为国家、公民和社会等组成的多元主体；治理手段主要为设置自治性程序和激励性程序：自治性程序是指在刑事诉讼中,刑事被害人对刑事纠纷的追诉、纠纷解决享有自主决定权的程序；激励性程序是指刑事诉讼中,被追诉者愿意主动认罪,接受刑罚时所应当减轻处罚的程序。