中国西门塔尔牛和安格斯牛的肉用性能良好,是内蒙古通辽地区饲养的主要肉牛品种。牛肉背部脂肪沉积情况是衡量牛肉营养价值和生产机能的主要指标。对屠宰试验所得的肉质数据进行独立样本T检验,发现中国西门塔尔牛和安格斯牛在剪切力、滴水损失、熟肉率和背膘厚度都存在极显著差异(p<0.01)。并对相关数据进行聚类分析,筛选出中国西门塔尔牛和安格斯牛各三头牛的背膘组织进行送样测序。通过BGISEQ-500平台获取了 6个背膘样品的转录组测序数据,结果显示样品比对基因组的平均比对率为92.32%,比对基因集的平均比对率为80.69%。一共检测到21,970个基因,检测出19,747个新转录本,其中16,576个是预测编码的转录本,15,643个属于已知蛋白编码基因的新的可变剪接亚型,933个属于新的蛋白编码基因的转录本,剩下的3,171个属于长链非编码RNA。GO功能分类注释到生物学过程的差异表达基因为3,149个、细胞组成的差异表达基因为2204个和分子功能数据库中的差异表达基因890个,并将三大功能类进行了单独的的分类和富集分析。通过KEGG代谢通路分析牛背膘组织的Unigene,参与了 6大类共44小类的代谢通路,并且一共注释到了 2158个基因。从中筛选出差异基因,并与屠宰试验的相关数据进行结合,通过qPCR验证了转录组数据的准确性,初步预测基因DKKL1、ACACB和PTGS2是脂肪沉积相关的候选基因。