扁角豆芫菁滞育发生及调控关键基因筛选与功能鉴定

来源 :贵州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lemayn
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
芫菁科昆虫因体内含有斑蝥素,而具有重要的药用价值,是一种传统中药材资源。随着斑蝥类药物在治疗皮肤病、水肿病、狂犬病及多种癌症的广泛应用,临床上对斑蝥素药源材料的需求量急剧增加。目前野生芫菁仍是药用斑蝥素及其衍生物的主要来源,而且野生芫菁资源有限和斑蝥素的人工合成条件苛刻。芫菁规模化人工养殖是解决斑蝥素资源短缺的主要途径,但因其特殊的复变态生活史和滞育时间较长特性,制约了该类昆虫资源的开发利用。扁角豆芫菁Epicauta impressicornis是我国西南常见种类,体内斑蝥素含量较高,是潜在斑蝥资源。本文以扁角豆芫菁为研究对象,探索不同温度下该虫的生长发育特性及滞育诱导条件,构建该虫全长参考转录组数据库,开展幼虫不同滞育阶段比较转录组分析并筛选滞育关联基因,克隆滞育关键基因并分析其表达特性,明确不同滞育阶段糖代谢物质的变化规律,初步鉴定滞育关键基因的功能,为下一步缩短其幼虫期,增加年繁殖代数,减少人工饲养周期提供参考。主要研究结果如下:1.不同温度下扁角豆芫菁生长发育特性及滞育诱导条件构建了不同温度(21、24、27、30、33和36℃)下扁角豆芫菁实验种群的生命表。结果显示,温度对扁角豆芫菁发育历期、存活率、繁殖力和种群生命表参数均有显著影响。经比较,饲养该虫的最佳温度策略为27至30℃。不同温光组合条件下滞育诱导实验表明,温度较光周期对扁角豆芫菁5龄幼虫的滞育诱导效能更显著,温度对滞育过程起主导作用。12℃温度可有效诱导5龄幼虫进入滞育和高于18℃时可有效延缓其进入滞育;而温度高于21℃时,5龄幼虫不发生滞育。研究结果为后续转录组取样提供依据。2.基于联合测序构建扁角豆芫菁全长参考转录组数据库通过Illumina Hi Seq X Ten和Pac Bio Sequel双平台对扁角豆芫菁6个生长发育时期共18个样品及其等量的混合样品进行测序分析,将获得的全长转录本与八大功能数据库进行比对注释。结果显示,共得到去冗余全长转录本序列信息28,276条;预测可变剪切事件1,380个、简单重复序列53,566个、编码蛋白框22,804个、长链非编码RNA 2,382个和转录因子51个;获得Nr数据库功能注释25,775条。研究结果丰富了扁角豆芫菁基因信息和为不同滞育阶段转录组分析提供数据支撑。3.扁角豆芫菁不同滞育阶段转录组特征以扁角豆芫菁全长转录组作为参考,对其幼虫不同滞育阶段转录组进行测序分析。结果显示,正常发育组与滞育组的差异表达基因(DEGs)有3,003个,滞育组与滞育解除组的DEGs有3,832个,滞育解除组与正常发育组的DEGs有589个;注释后获得滞育期有49个上调和7个下调基因。GO功能富集分析获得滞育组在维持其生命活动的生物学功能方面明显不同于非滞育组(正常发育组和滞育解除组)。KEGG通路富集分析发现脂肪酸生物合成和糖类代谢通路密切相关的淀粉和蔗糖代谢在调控滞育过程中具有重要作用。基于以上数据预测并筛选获得滞育关联基因共20个,采用qRT-PCR明确了19个基因的表达量变化趋势与转录组测序数据一致。同时,在5龄幼虫滞育的5个不同时间点比较了这些基因的表达量,获得13个基因在30d表达量较高,表明它们可能参与扁角豆芫菁滞育的调控。研究结果表明从转录水平探究扁角豆芫菁滞育发生具有重要意义。4.扁角豆芫菁Tret1、GD和SD基因的克隆及分析基于扁角豆芫菁筛选的滞育关联基因信息,运用PCR克隆海藻糖转运蛋白Tret1、葡萄糖脱氢酶GD和山梨醇脱氢酶SD基因,对其进行生物信息学分析,并利用qRT-PCR分析它们的表达特性。结果显示,EPTret1、EPGD和EPSD基因全长分别为1,710bp、2,225bp和1,253bp,它们均无信号肽,但有磷酸化位点、糖基化位点和跨膜结构。它们的编码蛋白均存在1个保守结构域。EPTret1和EPGD蛋白的三级结构寡聚物类型为单体,而EPSD蛋白为同型二聚体,它们均有α-螺旋和β-折叠结构。EPTret1、EPGD和EPSD氨基酸序列分别与鞘翅目昆虫的Tret1、GD和SD同源序列的一致性为51.03%、69.84%和78.02%;在系统发育树中扁角豆芫菁的EPTret1、EPGD和EPSD分别与赤拟谷盗的TCTret1、TCGD和TCSD序列聚为一支,亲缘关系最近,这与传统昆虫分类观点一致。EPTret1和EPSD基因的表达量在胸部和脂肪体最高,而头部最低,EPGD基因的表达量在胸部最高和脂肪体最低;EPTret1、EPGD和EPSD基因的表达量均在5龄初幼虫最高。研究结果为深入探究EPTret1、EPGD和EPSD基因在扁角豆芫菁滞育过程中的作用提供依据。5.扁角豆芫菁不同滞育阶段糖代谢物质的变化规律采用蒽酮法和酶标法等对扁角豆芫菁5龄幼虫不同滞育阶段进行糖代谢物质测定,并利用qRT-PCR对Tret1、GD和SD基因及在不同滞育阶段的糖代谢相关的基因进行表达解析。结果显示,扁角豆芫菁滞育组的海藻糖含量和山梨醇含量极显著高于正常发育组,糖原含量极显著低于正常发育组,而葡萄糖含量在96h极显著高于正常发育组和48h无显著差异;滞育解除组的海藻糖和糖原含量高于正常发育组,而山梨醇含量在48h显著高于正常发育组,而96h略低无显著差异,葡萄糖含量较正常发育组的在48h略高但96h较低。正常发育组的海藻糖酶活(TRE1和TRE2)在不同时间点变化不大,而滞育组和滞育解除组的TRE1和TRE2酶活分别呈逐渐略有升高和逐渐降低趋势。以上结果表明在滞育期间扁角豆芫菁5龄幼虫主要积累海藻糖和山梨醇,糖原可能转化为海藻糖和山梨醇。在不同滞育阶段的Tret1、GD和SD基因表达量存在明显的差异。不同滞育阶段糖代谢(海藻糖代谢、山梨醇代谢和其他糖代谢)过程中相关基因的相对表达量各不相同,表明不同滞育阶段的糖代谢过程是多基因多维度调节的复杂过程。研究结果为阐释扁角豆芫菁滞育分子机理和鉴定滞育关键基因的功能提供生理代谢方面的参考资料。6.扁角豆芫菁Tret1、GD和SD基因的功能鉴定通过RNAi显微注射法鉴定了扁角豆芫菁Tret1、GD和SD基因在不同滞育阶段的生物学功能。结果显示,注射dsTret1、dsGD和dsSD后,相应的目的基因转录水平在不同滞育阶段均降低,尤其在滞育组均为极显著降低,说明在试虫滞育阶段可有效抑制Tret1、GD和SD基因表达。与对照组dsGFP相比,5龄幼虫不同滞育阶段表型特征(自身体型、体色和活动力)均有所变化;试虫不同滞育阶段的海藻糖、糖原、葡萄糖和山梨醇含量及海藻糖酶活性变化均各自存在差异,其中在滞育组表现较为明显;糖代谢(海藻糖代谢、山梨醇代谢和其他糖代谢)过程中相关基因在不同滞育阶段的相对表达量均各不相同。表明Tret1、GD和SD基因对扁角豆芫菁滞育发生过程中具有重要作用;扁角豆芫菁滞育过程中关键的糖代谢是由多基因多维度介导的。研究结果为Tret1、GD和SD基因调控扁角豆芫菁滞育提供了主要线索,有助于从分子生物学角度为调控扁角豆芫菁滞育的靶标基因提供科学依据。
其他文献
红螯螯虾(Cherax quadricarinatus)是我国引进的优良淡水经济虾类,随着养殖规模的扩大,细菌性疾病愈加严重,特别是副溶血弧菌(Vibrio parahemolyticus)的感染最为普遍。了解水生环境中病原微生物和宿主的相互作用,开展红螯螯虾抗副溶血弧菌感染分子机制的研究,能深入了解红螯螯虾抗感染的免疫机制,为选育优质高抗个体奠定基础。本研究在实验室条件下,建立副溶血弧菌感染红螯
学位
粮食安全是人类立世之本,也是绿色高效农业的首要任务。小麦(Triticum aestivum)是世界第一大、我国第二大粮食作物,对我国和全球粮食安全持举足轻重之要。病虫害严重威胁作物产量和粮食安全,植物生长发育同抗病虫防卫反应之间的关系,遵循相生相克、此消彼长的动态对抗运作规律,此即科学界最近高度关注的“生长-防卫博弈(growth-defense tradeoff)关系”。博弈所致,植物免疫反应
学位
L-瓜氨酸(L-Citrulline,L-Cit)是一种非必需氨基酸,参与多种生理活动,包括一氧化氮(Nitric Oxide,NO)合成、蛋白质合成、肠道功能和能量代谢。近年来在L-Cit的代谢方面已有了较为深入的研究,但对其在动物生产中的应用仍缺乏研究。本文通过七个方面的试验研究明确了L-Cit在家禽生产中的抗热应激效应,特别是在机体体温调节和一氧化氮合成中的作用,为L-Cit在家禽生产中的应
学位
我国是海洋大国,若要提高海洋资源开发能力,维护国家海洋权益,建设海洋强国,则必须发展海工装备,开发先进的海洋材料。在海工装备建造过程中,焊接是一种重要的连接工序,可直接影响海工装备的整体质量。先进的自动化大线能量焊接技术已经在船舶及海洋工程领域广泛应用,大幅提高了焊接施工效率,保障了焊接质量和性能的一致性。然而,由于大线能量焊接技术具有焊接峰值温度高、焊后冷却速度缓慢的特点,在焊接热影响区(Hea
学位
人们使用语言进行交际的过程,也是传递信息的过程。由音高、音长、音强构成的语调、节奏和重音体现了言语中句子的韵律特征,信息结构理论为言语中句子的韵律编码方式提供了理据。节奏单元层级结构在具体语境中叠加上功能语调和焦点重音的凸显才成为言语中的句子,语调的韵律编码使其确立逻辑、口气和情感表达的基调,边界等级的韵律编码反映句中各节奏单元间或松或紧的语义联系,焦点则为句子的信息结构提供了信息量的标记。此研究
学位
目前,微生物功能基因已广泛应用于研究、医疗、工业领域,而这些基本都来自可培养微生物。环境中未培养的微生物超过99%,它们的基因资源尚未得到有效开发。在本项研究中,我们开发了通过比较宏转录组学和基因组学来挖掘未培养微生物功能基因的方法,并以黄河兰州段西固工业区土壤微生物群落为研究对象来验证其可行性。本研究分为三部分:i)黄河兰州段西固工业区常年受重金属污染,尤其是铬(Cr)。因此,本研究中前期研发的
学位
一方面,世界上许多受过高等教育的人所作出的不公正行为,反映了教育体制在培养人们的批判性思维方面的失败,包括伦理理性——公正批判性思维。另一方面,中国的传统教育体系在加强学生技能方面做出了巨大的努力,在标准化考试和数学等学科上取得了成功。中国在多年来取得了重要的成绩,这一点得到了世界的认可。然而,一些研究表明,中国学生的批判性思维能力仍然有限。研究还表明,部分原因是,中国的中等及高等教育课程中没有明
学位
斜纹夜蛾Spodoptera litura(Fabricius)隶属鳞翅目Lepidoptera夜蛾科Noctuidae,是一种重要的世界性农林害虫。该虫分布广,寄主多,适应能力及繁殖能力强,对多种作物均能造成严重的危害,尤其是棉花、大豆、烟草等重要经济作物。目前对斜纹夜蛾的防治仍以化学防治为主,但常规药剂药效差,其幼虫也普遍产生抗药性,为该虫的防治造成极大的困难。昆虫行为是昆虫为更好的适应环境而
学位
赤螨科Erythraeidae隶属于蜱螨亚纲Acari、绒螨目Trombidiformes,是赤螨总科Erythraeoidea的重要科级单元,迄今世界已知62属、850余种。该科属、种的证据标本十分复杂:30属基于幼螨标本描述,18属基于成螨标本描述,14属幼螨和成螨标本有描述;580余种基于幼螨描述,47种基于成螨和幼螨描述。该科的另一特点是单种属和寡种属(少于10种)多:单种属27个,其中1
学位
超级电容器既具有电容器快速充放电的特性,又具有电池的储能特性,兼具高功率密度和优异的循环稳定性而被广泛应用在各个领域。镍基硫化物因具有高理论容量而被广泛研究。由于单一相的镍基硫化物在充放电过程中出现的结构坍塌,使得镍基硫化物电极循环稳定性较差;其次是工作电压窗口较低(被限制在0.3-0.7 V),导致了较低的能量密度。因此致力于开发镍基硫化物复合材料的同时,引入杂元素来扩宽材料的电压窗口,从而提高
学位