【摘 要】
：
药物引起的肝毒性可能引起急慢性肝病,造成对患者生命安全的危害。这也是药物从市场撤回的主要原因之一。为了在药物研制的早期测定药物的肝毒性,过去常用动物实验的方法去测定,然而由于这种方法面临很大的人道主义以及效率较低的问题,越来越多的研究者使用药物毒性基因组学数据进行肝毒性预测。通过对基因表达数据的数据挖掘,可以更有效的预测药物的肝毒性。在我们的研究中,我们提出了一种基于基因表达和毒性数据的多剂量计算
论文部分内容阅读
药物引起的肝毒性可能引起急慢性肝病,造成对患者生命安全的危害。这也是药物从市场撤回的主要原因之一。为了在药物研制的早期测定药物的肝毒性,过去常用动物实验的方法去测定,然而由于这种方法面临很大的人道主义以及效率较低的问题,越来越多的研究者使用药物毒性基因组学数据进行肝毒性预测。通过对基因表达数据的数据挖掘,可以更有效的预测药物的肝毒性。在我们的研究中,我们提出了一种基于基因表达和毒性数据的多剂量计算模型,以预测药物诱导的肝毒性。我们通过对药物在不同浓度下的作用拟合出基因表达关于药物浓度变化的量效曲线,并且从量效曲线中提取出四种常用参数用于代表整个量效曲线的信息。在我们的研究中,充分利用了药物治疗后的剂量/浓度信息,因此考虑了更丰富的剂量反应关系代表。我们还提出了一种新的特征选择方法,称为MEMO,这也是我们研究中多剂量模型的重要方面,用于处理高维毒理基因组学数据。我们使用TG-GATE数据集验证了提出的模型,这是一个大型数据库,可从多个角度记录毒理基因组学数据。通过MEMO算法对基因数据进行特征选择,使基因数据从9987维降低到268维,同时准确率由53.7%提升到了97.1%。实验结果表明,使用所提出的预测模型可以高精度和高效地预测药物引起的肝毒性。
其他文献
近年来,社区养老风气盛行,为了照顾老人膳食健康的社区共餐食堂出现的也越来越多。而共餐食堂存在的意义不仅是为老人提供营养均衡的饭菜,更是希望老人能借此多出门活动,从而达到延长老人健康状态的真正目的。目前,社区老人共餐食堂仍在起步发展阶段,相关数据及设计经验较为匮乏。老人共餐食堂通常会与街道办,养老机构,以及民间单位共同合办,因此也造就出在地多样的共餐环境。本文通过既有的社区老人共餐食堂的起源与发展,
移动设备已经成为增强现实技术的重要应用平台,人们为了随时随地体验AR技术带来的便捷生活,行动AR技术应用逐渐兴起。随着行动AR技术的发展,移动设备的弊端也逐渐显现。移动设备由于是固有的嵌入式系统,在数据库扩展性和计算能力等方面都存在不足,行动AR应用的性能也受到限制。行动AR系统的性能表现包括:标记内容的可扩展性和系统的实时性。如何能够兼顾行动AR系统的可扩展性和实时性成为急需解决的行动AR技术发
社团发现是复杂网络研究领域的一个重要任务,利用网络拓扑信息与文档内容信息进行社团检测与语义解释已成为复杂网络分析领域新的发展趋势。然而目前的相关研究工作仍存在如下问题。首先,大部分方法都认为社团的定义为:内部结点连接紧密,组间连接稀疏的点的集合。因此,基于此概念的社团发现方法通常难于检测到真实世界存在的其他类型的社团结构。也就是说目前很多方法无法检测到广义的社团结构。其次,在真实网络中,一个社团可
近年来,皮肤摩擦学的研究引起了人们的广泛关注。人体皮肤摩擦性能的表征与摩擦行为的研究及其应用成为生物力学和摩擦学、化妆品、临床以及机器人系统等领域的研究热点。目前,众多学者从理论,实验,数值模拟等角度开展研究,已取得了一定的研究成果。但由于皮肤固有的低弹性模量和对外部刺激的高敏感性,使得皮肤受载后表现出明显的非线性特性,并且皮肤不同于传统的工程材料,它不遵循传统的摩擦理论（阿蒙顿定律）,皮肤摩擦会
近年来,随着国内经济水平的不断提高,人们的生活质量也在不断改善。人的一生约80%的时间是在室内度过的,室内空气质量和热舒适状况直接影响着生活质量的好坏。因此,近几年关于室内环境的研究层出不穷,包括室内通风潜力、影响因素以及人员行为研究等。但对温和地区的室内环境状况的研究较少。另外,对于室内空气质量长期监测样本量的科学确定的研究也较为缺乏。本文首先采用长期监测的方法,对温和地区的13户住宅的室内环境
应用商店允许用户对下载的应用程序进行评论,这些评论信息可以直接或者间接的反映用户意图。持续准确的挖掘用户意图可以极大的帮助开发人员维护和改善他们的APP。然而,由于应用评论具有数据量大、非结构化以及评论质量不一等特点,如何高效的挖掘评论中对开发者有用的信息,并将热点评论信息推荐给开发者成了软件开发中重要问题。为了解决上述问题,本文提出了一种基于用户评论分析的APP维护意见挖掘及推荐方案。首先,将用
在航空航天、电力、机械等工程领域各种对于结构健康进行监测的方法越来越得到人们的重视。近年来,FBG传感器因为其体积小、质量轻、对电磁干扰不敏感、容易进行复用、容易埋入各种结构内部构成智能结构等优点,被广泛应用于结构健康监测领域。本文提出了一种基于单FBG振动传感器的结构损伤位置识别算法。在基于振动响应的无损检测原理的基础上,通过搭建高速FBG传感解调系统采集待测结构的振动响应信号,从振动响应信号中
手绘建筑图是一种传达设计理念的重要工具和艺术形式,是建筑设计师在建筑设计完成后将想法表达出来呈现给用户的主要途径。一幅好的手绘风格建筑图需要专业设计师花费大量的时间与精力才能绘制完成,并且在设计师灵感比较活跃的设计初期常常需要绘制多幅这样的手绘风格建筑图才能真正将设计师的想法展现出来,这是极其费时费力的工作。为便于手绘风格建筑图的生成,本文提出了一种新的基于生成对抗性网络（GAN）的线条建筑手绘风
随着互联网的普及和大数据的快速发展,人们从海量数据中获取有效信息的难度越来越大,因此对个性化推荐的需求也越来越高。基于主流社交媒体的发展和用户的动态的兴趣偏好,本文针对推荐系统中数据稀疏性问题进行研究和分析,并提出解决方案:本文通过引入用户行为的时间信息和跨系统的社交信息,提出了融合社交信息和时间效应的协同过滤推荐模型（STCF）。首先利用LSTM网络对用户的短期兴趣偏好进行建模,整合用户长、短期