当前,我国正处于对医疗体制改革的探索过程中,特别是对公立医院的改革探索,其中医院的补偿机制研究是探索的主要目标。新医改方案把原先的由医疗服务收费、财政补助、药品收入三种补偿渠道缩减为医疗服务收费、财政补助两种补偿模式,这也引发了公立医院改革的艰难之路,补偿的不足致使公立医院不得不拓宽补偿方式,通过多种渠道进行有效补偿。本文通过公共管理学、公共经济学、卫生管理学等理论通过文献研究法、对比归纳法、比较分析法以及规范性与实证性相结合的方式以陕西省部分县级公立医院为例,通过对陕西省3家县级公立医院医院的研究,尝试从问题原因着手,以此进行问题分析发现目前县级公立医院主要存在的问题有(1)财政补偿严重不足；(2)医疗服务收费价格定制不合理；(3)药品收入来源比重过大；(4)其他类型收入比例过少。针对这些问题以此为基础结合国内外关于公立医院的相关研究结果剖析问题的深层次原因,即有公立医院本身内部管理失效也有政府补偿不到位,既有体制上的问题,也有思想上的问题。本文针对县级公立医院补偿机制的问题和原因进行全面分析后,从补偿渠道入手分别以财政补偿和医疗服务补偿为核心提出相关建议和意见。主要有(1)县级公立医院补偿机制改革的总体原则(2)财政补偿机制建议(3)医疗服务补偿机制建议(4)其他相关建议。最终为政府对公立医院的改革提供突破口,同时也明确政府职责,促使公立医院回归公益性。