miR-1246靶向Kindlin-2调控宫颈癌细胞自噬、迁移和侵袭的机制研究及自噬相关预后模型的构建

来源 :广西医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zongduzhicai
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
第一部分miR-1246靶向Kindlin-2调控宫颈癌细胞的迁移和侵袭目的:筛选并确认miR-1246调控宫颈癌细胞迁移和侵袭的功能性靶基因。方法:利用生物信息学数据库预测miR-1246的潜在靶基因,并结合文献和基因表达水平,挑选出目标靶基因;Western blot探究miR-1246对靶基因蛋白表达的作用;双荧光素酶报告基因实验确认miR-1246与目标靶基因的具体结合位点;分别使用RT-qPCR和免疫组化检测临床标本miR-1246和靶基因的表达,分析两者表达相关性;回复实验验证靶基因在miR-1246调节细胞迁移和侵袭过程中的必要性。结果:Kindlin-2被筛选作为目标靶基因;RT-qPCR和免疫组化结果表明miR-1246和Kindlin-2在宫颈癌组织中表达负相关;Western blot结果显示miR-1246能下调Kindlin-2的表达;双荧光素酶报告基因试验确认Kindlin-2的3`UTR与miR-1246的结合位点;回复实验证实Kindlin-2能逆转miR-1246诱导的细胞迁移和侵袭。结论:Kindlin-2是miR-1246的靶基因,miR-1246通过与Kindlin-2的3`UTR的位点结合,下调Kindlin-2的表达,促进宫颈癌细胞的迁移和侵袭。第二部分Kindlin-2通过AKT/mTOR介导的自噬抑制宫颈癌细胞迁移和侵袭目的:探究Kindlin-2对宫颈癌细胞自噬、迁移和侵袭的调控及具体机制,分析Kindlin-2在宫颈癌中的表达情况,及其与临床病理因素和患者预后的关系,探讨Kindlin-2在宫颈癌中的生物学功能和临床意义。方法:利用生物信息学数据库和临床标本分析Kindlin-2在宫颈癌中的表达情况。在两株宫颈癌细胞系中分别上调和下调Kindlin-2,使用Western blot检测自噬相关蛋白,共聚焦显微镜检测自噬流,电子显微镜观测自噬超微结构,以探究Kindlin-2对细胞自噬的影响。Western blot检测下游通路蛋白的变化情况,回复实验探究通路在Kindlin-2调节细胞自噬过程中的必要性。划痕实验和Transwell实验探究Kindlin-2对细胞迁移和侵袭的作用,回复实验探究自噬在Kindlin-2调节细胞迁移和侵袭过程中的必要性。RT-qPCR检测Kindlin-2在宫颈癌组织中的表达水平,并分析其与临床病理因素的联系。结合公开数据库,探究Kindlin-2表达水平与患者预后的关系。结果:在宫颈癌组织中,Kindlin-2的m RNA和蛋白质水平均下调。Kindlin-2增加了自噬蛋白标志物LC3-Ⅱ,同时降低了p62的表达水平;自噬流检测结果显示Kindlin-2增加了黄色光点和红色光点的数量;透射电镜观察到Kindlin-2提高了自噬体和自噬溶酶体数量。Western blot表明Kindlin-2降低了p-AKT和p-mTOR的表达水平,回复实验表明,Kindlin-2对自噬的调控依赖于AKT/mTOR通路。划痕实验和Transwell实验表明Kindlin-2抑制了细胞的迁移和侵袭,回复实验表明自噬是这一过程所必需的。Kindlin-2低表达与较深的间质浸润深度和较高的淋巴结转移率有关,同时与较短的DFS有关。结论:Kindlin-2通过AKT/mTOR通路介导的自噬抑制宫颈癌细胞的迁移和侵袭,Kindlin-2低表达提示宫颈癌预后不良。第三部分基于自噬相关基因建立宫颈癌的预后模型目的:通过生物信息学方法对高通量基因表达数据进行分析,基于自噬相关基因(ATGs)表达谱建立一个宫颈癌的预后预测模型。方法:从癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)和基因表达汇编(GEO)数据库中获取宫颈癌病例的基因表达谱和临床资料,从人类自噬数据库(HADb)中获取ATGs列表。将TCGA病例随机平均分到训练集和测试集中,在训练集中进行单因素Cox回归分析,初步筛选出与患者预后相关的ATGs,然后通过最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归进一步缩小基因数量。根据多因素Cox回归系数与基因表达量构建预后模型,计算每个病例的风险评分,根据风险评分将病例分为高风险组和低风险组。通过Kaplan-Meier生存分析和受试者工作特征(ROC)曲线对预后模型的预测效能进行评估。多因素分析以及分层分析评估预后模型的独立预后价值。使用基因本体论(GO)以及京都基因与基因组百科全书(KEGG)对模型中的ATGs及其相关基因进行富集分析,基因集富集分析(GSEA)探究高危组患者的基因富集通路,揭示该预后模型可能的作用机制。结果:单因素Cox分析显示33个ATGs与训练集患者预后相关,然后用LASSO回归方法筛选出其中8个基因(VEGFA、TM9SF1、NAMPT、KLHL2、HSPA8、HSP90AB1、HGS、ATG4D)构建预后模型。该模型能将TCGA和GEO数据集中的宫颈癌患者分为预后明显不同的高风险和低风险组,ROC分析表明1年、3年和5年生存期的曲线下面积分别为0.746,0.750和0.791。多因素分析以及分层分析进一步证实了该模型的独立预后价值。此外,GO、KEGG和GSEA分析揭示了预后模型相关的几个基本信号通路和生物过程。结论:我们构建并验证了一个新的基于8个ATGs的预后模型,它可以作为宫颈癌患者的独立预后因素。
其他文献
背景与目的原发性肝癌是全球癌症相关死亡第三大主要原因,每年死亡病例约78万例,每年新增病例约84万例,发病率居全球恶性肿瘤第七位。在我国,原发性肝癌死亡率仅次于肺癌、胃癌,位居恶性肿瘤死因第三位。肝细胞癌(hepatocellularcarcinoma,HCC)是原发性肝癌中最常见的组织学类型。尽管外科手术是HCC患者的主要治疗方法,但由于HCC早期症状较为隐匿,大多数患者在确诊时已处于疾病进展期
背景:百草枯(paraquat PQ)是一种剧毒除草剂,能引起以急性肺损伤为代表的多脏器损害。临床中发现百草枯中毒患者血NT-pro BNP(氨基末端脑钠肽前体)可明显升高,其变化特点与原因尚不清楚,如果补充外源性BNP(重组人脑利钠肽,rh BNP)是否能对PQ中毒患者产生保护性影响尚不清楚。现阶段在临床已有关于补充rh BNP治疗脓毒症相关急性肺损伤的研究并取得一定成效,这为rh BNP治疗百
冠状动脉微栓塞(Coronary Microembolizaiton,CME)是急性冠脉综合征患者冠状动脉发生粥样硬化后易损斑块破裂,或者经皮冠状动脉介入治疗时微血栓栓子或动脉粥样硬化斑块碎屑进入冠状动脉微循环所导致的微循环血管堵塞。CME引起的无复流是冠脉介入治疗过程中的常见并发症,而无复流是影响患者远期预后的主要因素。多个研究也表明CME与心脏不良事件的发生相关,包括左室重构及死亡率增加。尽管
第一部分miR-320a和RACK1在结直肠癌中的表达与临床意义目的:结直肠癌(colorectal cancer,CRC)在世界范围内发病率较高,是严重危害人类健康的重大疾病。我国CRC的发病率依然呈上升态势。早期发现、早期诊断、早期治疗可以获得较高的治愈率和较好的预后。故进一步探究CRC的发病机制,找寻新的无创肿瘤标志物与治疗靶点,对CRC的早期诊断、药物研发以及改善预后均具有重要的临床意义。
梅尼埃病(Meniere’s disease,MD)是一种一种临床常见的内耳特发性眩晕疾病。目前病因和发病机制不明。本研究通过回顾性分析难治性梅尼埃病患者三个半规管阻塞术后的临床疗效以及通过检测核因子NF-κB在梅尼埃病患者中差异性表达,探讨难治性梅尼埃病的治疗方法和梅尼埃病发病过程中作用机制。第一部分难治性梅尼埃病患者三个半规管阻塞术后临床疗效分析目的:探讨三个半规管阻塞术应用于难治性梅尼埃病患
第一部分生物信息学分析结直肠癌患者组织中整合素α6/β4的分布情况目的:通过生物信息学分析整合素α6(Integrinα6,ITGA6)及整合素β4(Integrinβ4,ITGB4)在结直肠癌(Colorectal cancer,CRC)组织及正常组织中的分布情况。材料与方法:本研究第一部分将(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中结肠癌和直肠癌数据与其配对的癌旁正常
第一部分VIPR1表达对肝细胞癌临床病理特征及预后的影响目的:研究肝细胞癌组织中VIPR1的表达情况,并就VIPR1表达与临床病理特征和预后间的关系进行分析。方法:从桂林医学院获取组织芯片,其包含95例肝细胞癌组织和80例配对的癌旁组织。通过Oncomine数据分析和免疫组织化学方法研究VIPR1在肝细胞癌组织中的表达情况。采用Pearson chi-square检验分析VIPR1表达与HCC(H
目的评估Duchenne型肌营养不良(DMD)患儿下肢肌肉脂肪浸润和炎性水肿的MRI受累模式及与肌力评分、肌酸激酶(CK)和不同基因突变类型的相关关系。探讨DMD患儿糖皮质激素治疗前后臀大肌和大收肌的T2值、脂肪分数(FF)及R2water值的变化在短期无创性疗效评估的价值。方法1.选择经基因确诊的DMD患儿35例,对大腿及小腿的29块肌肉和大腿的15块肌肉分别进行脂肪浸润和炎性水肿评分。骨骼肌脂
目的:通过研究宫颈癌异位移植瘤不同生长时间CEUS的TIC参数与肿瘤微血管生成特点及癌细胞增殖的相关性,探讨CEUS的TIC参数在宫颈癌诊治中的应用价值。方法:本文选取21只裸鼠,建立宫颈癌异位移植瘤模型后平均分为三组,分别于移植后7d、14 d及21 d进行CEUS,获取肿瘤的CEUS声像图表现、TIC曲线特点及TIC参数(包括AT、PI、TTP、HT、Grad、AUC)。将裸鼠移植瘤组织剥离并
目的:通过对MCM家族基因的生物学功能和代谢通路的研究,使用单中心队列研究MCM2和MCM3蛋白表达在LGG中的预后价值,分析MCM家族基因对LGG的临床价值并做初步的机制探索。材料与方法:收集TCGA数据库LGG中MCM基因家族m RNA基因表达谱数据及相应的临床资料。对正常脑组织和脑肿瘤组织中MCM基因表达的对比,MCM基因在不同分级较LGG中的表达对比,分析MCM家族基因对LGG的临床价值,