猪源IFITMs N端结构域抗病毒功能研究

来源 :湖南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:maailin
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
干扰素诱导跨膜蛋白(interferon-induced transmembranes,IFITMs)属于一类小跨膜蛋白,已被证明广泛分布在脊椎动物体内。在进化过程中,IFITMs具有较高的保守性,其中IFITM1、IFITM2、IFITM3与机体的抗病毒天然免疫反应相关,它们通过多种途径和机制来限制病毒的感染。现有的研究认为,IFITMs是唯一一类阻断病毒膜融合过程的效应因子。已有大量研究报道了IFITMs的抗病毒活性,多种囊膜病毒和部分非囊膜病毒均位于IFITMs的抗病毒谱内,但其确切的抗病毒作用机制仍需进一步研究确定。本文主要就猪IFITMs的遗传进化关系、结构、功能等特征进行分析和探索。1.为探明猪IFITMs遗传进化关系、结构特征,本研究完成了猪IFITM1、2、3基因的克隆,利用生物信息学方法对IFITMs进行分析和预测,结果显示IFITMs基因编码区由两个外显子构成,所编码的蛋白均属于稳定蛋白,整体显示疏水性,理论等电点位于偏碱性环境;不同物种的IFITMs具有较高的保守性,保守区主要位于蛋白分子中部的CD225结构域;猪IFITM1、2、3基因均与黑猩猩同源性最高,同源性分别为70.2%、67.7%、70.5%;预测显示IFITM1、IFITM2和IFITM3同样为二型跨膜蛋白,分布定位于质膜、内体膜等结构上,部分暴露于细胞质中,不具有信号肽和酶结合位点;同源建模显示IFITMs分子富含α-螺旋结构,IFITM2和IFITM3的N端无规则卷曲,可能存在一个内吞分拣信号,在CD225结构域中存在一个两亲性的螺旋结构和一个疏水区域;结合比较基因组学研究,筛选预测出了Y19、K23、C70等一些功能性残基和结构基序。2.利用大肠杆菌和亲和层析的方法表达、纯化猪IFITM1、2、3的蛋白,并将蛋白与佐剂混合后免疫动物,成功制备了兔源anti-IFITMs的克隆抗体,蛋白质免疫印迹结果表明抗体与IFITMs具有良好的特异性反应,为后续试验提供了条件。3.为进一步阐明IFITMs在多种猪病毒感染中的抗病毒作用,本研究在细胞水平上探索了IFITMs与TGEV、PRV和PCV2的互相作用关系,结果显示TGEV、PCV2感染PK15细胞24h后,IFITM1和IFITM3的m RNA水平均出现上调,并在36h后进一步升高,而在PRV感染的PK15细胞中,IFITM1、3的转录水平仅表现短暂上升然后显著下调;过表达IFITM1对TGEV、PRV和PRV感染PK15细胞均有不同程度的抑制作用,过表达IFITM3同样降低了TGEV和PCV2的复制水平,但在过表达IFITM3的细胞中未能检测到较空载体对照组更低的PRV感染。除此之外,IFITMs NTD结构域的截短诱变分析结果显示,IFITM3 NTD结构域的第19位到第56位的氨基酸残基(19YEMLKEEHEVAVLGAPQTSAPVATTVINIRSETSVPDH56)对于整个蛋白分子的抗TGEV活性具有重要贡献,而IFITM1的N端结构对于其抗病毒功能并非不可或缺。综上,本研究为深入了解猪IFITMs结构、遗传进化关系提供了新线索,证实了IFITMs在体外对TGEV复制的抑制作用,同时还分析了IFITMs NTD结构域上的功能性残基,这些结果将为猪IFITMs作用机制的研究奠定前期基础。
其他文献
随着中国经济的迅猛发展,矿山开发项目促进了中国的工业化和城市化进程。矿山的开采对矿区周边的生态环境造成了巨大的破坏,导致形成了大量的矿山废弃地。因此,对矿山废弃地进行修复,使其生境得到极大改善,也对废弃资源进行景观再利用,改造成集观赏休闲于一体的生态公园,成为了当下亟待解决的矿山废弃地的问题。借助多种科学的景观重塑与生态恢复的方法理论与策略,缓解人地矛盾;解决由于一些矿山的负面影响,从而实现产业转
豆粕是一种优质植物性蛋白质饲料,但含有各种抗营养因子。微生物发酵技术可以改善豆粕的营养价值,降解抗营养因子。本试验旨在研究发酵豆粕对泌乳中期奶牛的生产性能、瘤胃微生物及生理代谢的影响,旨在为发酵豆粕在奶牛生产中的应用提供参考。本试验选取南山牧业有限公司清溪奶牛场泌乳期(泌乳中期)、产奶量(20.3±3.4 kg)、胎次(1-2胎)、体重(460±50 kg左右)等相近的泌乳奶牛24头进行试验。对照
目的:新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)患者心理状况及影响因素。方法:收集2020年2月20日-2020年3月25日期间的385例COVID-19患者和53764例对照组一般资料,及患者组临床资料。采用自杀风险评估量表(The Nurses’Global Assessment of Suicide Risk Scale,NGASR)、匹兹堡睡眠质
近年来人们对健康产业的关注和对康养休憩场所的需求不断上升,中药材与休闲农业越来越多的出现在人们的视线中,将传统中药材产业运用到休闲农业中来是未来健康产业与休闲农业发展的潮流与趋势。台州舍得健康管理有限公司,是一个以中医药为主体产业的企业,现结合农业观光康养产业与中药材标准化栽培技术,拟以天台县张思村为“根据地”,以药食同源中药材、道地产区药材、观光药膳品种、特色康养资源和农业休闲旅游等方面为切入点
近几十年来,受环境污染,人为破坏等多种因素的影响,物种多样性下降的趋势非常普遍。物种多样性对维持系统结构稳定和功能完备起决定性作用,因而多样性丧失对系统稳定性和功能影响的研究一直是生态学研究的一个热点。物种多样性和生产力间的关系能够在一定程度上表征上述影响。物种多样性和生产力间的相关性主要有正相关,负相关,单峰效应和无相关四种模式,其中正相关模式受到的关注最多。互补效应(Complementari
毕氏肠微孢子虫、蓝氏贾第虫、隐孢子虫是三种重要的人兽共患肠道寄生虫,可感染人、家畜、宠物等多种动物。犬、猫是这三种病原体的重要宿主之一,作为宠物被饲养时常与家庭成员同吃同住、接触频繁且密切。本研究为了解云南省部分地区宠物犬猫这些病原体的感染情况,以及人兽共患风险,对该地区宠物犬猫进行了这三种病原体的检测和基因型鉴定。在云南省的宠物市场、宠物医院和收容所共采集到433份新鲜粪样,其中犬样262份,猫
Reg Ⅲγ是一种具有多种功能的抗菌蛋白,如抗炎、抗菌、促进损伤修复及细胞增殖等,在动物的先天免疫中具有重要的作用。由于RegⅢγ的多种生物学功能,其在实际的生产应用中具有极其广阔的前景。但到目前为止,RegⅢγ蛋白的相关功能研究主要集中在小鼠和人,其在猪体内的功能的研究报道较少。为深入研究猪Reg Ⅲγ蛋白的功能,本文构建了一种通过p DCP载体介导的重组表达系统,对猪Reg Ⅲγ进行原核重组表
经过近几年的发展,湖南的食用槟榔不断开辟市场,销售范围覆盖了全国20多个省市,发展成了湖南的一大产业。本研究通过正交试验设计优化了碱煮软化工艺,比较了优化与普通碱煮工艺的槟榔在口腔咀嚼过程中化学成分的变化。通过对咀嚼优化与普通碱煮工艺在煮籽、发籽、点卤前、点卤后4个工艺阶段槟榔的唾液进行分析,研究了两种碱煮方式在不同工艺阶段对口腔菌群的影响。具体结果如下:1、以感官评价与质构参数选择了食品级氢氧化
为了研究干旱胁迫对半夏(Pinellia ternata)不同种质的影响,为半夏品种选育及高效栽培技术提供科学依据,本研究以湖南省及周边县(市、区)的半夏常德、沅陵、资阳、毕节、京山等5个种质作为供试材料,对它们在林下干旱胁迫对照(土壤含水量为其田间持水量的70%~75%,CK)、轻度干旱胁迫(60%~65%,T1)与重度干旱胁迫(50%~55%,T2)处理条件下的植株的株高、地径与块茎直径、叶长
湖南省的烟草种植是我国国民经济中是不可或缺的一部分,该地区由于常年的烟稻轮作模式、单一耕作方法,导致了一系列如耕作层变浅、犁底层变厚,土壤物理特性、养分协调性降低等问题的发生。为解决上述问题,改善长沙稻作烟区土壤耕作条件,缓解耕地压力,提高烟叶的产质量,本研究通过大田试验,设置粉垄深耕(T1)1个处理和铧式犁翻耕(T2)、直接旋耕(T3)2个常规对照,探究不同耕作方式对长沙稻作烟区土壤物理特性及烤