浙江汉族人群单核苷酸多态性与胸主动脉瘤遗传易感性的研究

被引量 : 0次 | 上传用户:qunimadebicaocao
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
研究背景及目的胸主动脉瘤是一类逐渐被引起重视的心血管疾病,具有致死致残率高、治疗难度大等特点。其发病由多种高危因素促成,虽然该病主要为散发形式,然而遗传因素在其中占有重要作用,通过遗传学水平研究由于基因多态性产生的不同程度的遗传易感性,可加深对本疾病发病机制的进一步认识,并为疾病的防治提供重要依据。随着人类基因组计划的完成和单体型图谱的构建,以及高通量基因分型技术的快速发展,全基因组关联性研究应势而生,并成为目前探索复杂疾病易感性遗传因素最为有效的方法。近年来几个国外研究中心以西方人群为主要研究对象进行了基于全基因组关联性研究,发现多组单核苷酸多态性与胸主动脉瘤发病相关。如Vasan等延续Framingham心脏研究等,通过meta分析发现rs10852932,rs17470137,rs4026608等单核苷酸多态性(SNP)位点与美国白人主动脉根部扩张程度有关,潜在相关的基因包括CCDC100, PDE3A, HMGA2,SMG6,SRR,TSR等。Wineinger等通过高血压病的多中心研究——HyperGEN研究,发现位于7号染色体的CRCP和KCTD7基因之间、以及20号染色体的SIRPA和PDYN基因之间的大片编码区域和非裔美国人主动脉根部瘤样扩张相关,关联SNP包括rs10263935、rs6045676等。LeMaire等以欧裔白人的胸主动脉真性动脉瘤及夹层患者为研究对象进行GWAS研究,发现FBN1基因多个相关SNP与之发病相关。而目前在我国,心血管疾病的遗传学研究对象主要以集中在冠心病,高血压等高发疾病为主,胸主动脉疾病发病率相对较低,引起的关注相对较小。然而,胸主动脉瘤往往起病凶险,自然病程预后不佳,对其疾病发生机制有必要进一步深入研究。进行单核苷酸多态性与胸主动脉瘤遗传易感性的相关研究,对加深此类疾病的发病机制的认识,具有重要意义。近年来,以单核苷酸多态性为基础,通过进一步的研究方式,如单倍体型研究和基因交互作用研究等,在高血压、冠心病、腹主动脉瘤等心血管疾病研究领域取得了重要研究成果。然而在胸主动脉瘤方面,以我国汉族人群为研究对象,仍然鲜在单倍体型及基因交互作用分析水平上的研究成果,以此为研究手段,可进一步探究我国汉族人群的胸主动脉瘤疾病的致病遗传因素。目前认为,相同疾病在不同种族、人群之间致病基因及发生机制可能会有不同。基于国外相关研究进展以我国汉族人群为研究对象,在基因水平上研究我国汉族人群遗传易感性与胸主动脉瘤的关系,确认相关高危SNP位点、进而研究高危单倍体型和潜在的基因交互关系,有望进一步加深对胸主动脉瘤的发病机理的认识,为疾病预防、诊断、治疗等方面提供新的思路。研究对象与方法以浙江地区汉族人群为研究对象,采用病例对照研究方法,按照成组匹配原则入组胸主动脉瘤患者病例组及健康人群对照组,获取病例组及健康人群临床信息,对病例组进行临床诊断分型。提取研究对象的血样或主动脉组织DNA,采用直接测序法检测候选SNP位点:rs10263935,rs10757278,rs1333049,rs10519177,rs9806323,rs1036477,rs2118181,rs6045676及其基因型。对对照组人群进行Hardy-Weinberg检验。运用SHESIS软件,采用Pearson卡方检验比较对照组和病例组之间8个单核苷酸多态性多态性位点及各基因型分布差异,采用logistic回归模型计算OR值和95%可信区间。对同一染色体的多态性位点进行单倍体型分析,得出与疾病相关的高危或保护性单倍体型,并采用多因素降维法(MDR)进行多因素交互作用分析,判断在胸主动脉疾病发生机制中可能的基因间交互作用。结果病例组51例,其中男性36例,女性15例。根据胸主动脉诊疗指南,进行病例亚组分组,其中符合胸主动脉真性动脉瘤诊断病例34例,胸主动脉夹层诊断病例35例(有18例病例符合两种共同诊断),升主动脉病变组40例,非遗传综合征病例组44例。健康人群对照组79例,男性53例,女性26例。对照组样本的8个SNP位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(p>0.05),说明本研究选取的对照组SNP位点基因型频率处于平衡状态,具有群体代表性。对8个SNP位点检测结果在病例组及各个亚组和对照人群样本进行Pearson卡方检验,并采用logistic回归模型计算OR值和95%可信区间,结果显示CDKN2B基因相关的rs1333049GG基因型携带者增加胸主动脉瘤患病风险(OR=2.533);且各主要亚组结果也基本一致;FBN1基因相关的rs10519177的A等位基因在总体胸主动脉瘤患者病例组的分布频率高于对照组具有显著性差异,AA基因型增加胸主动脉瘤患病风险(OR=2.383),提示该基因型为危险因素,GG基因型降低胸主动脉瘤患病风险(OR=0.207),提示其为保护因素,且各主要亚组结果也基本一致;rs6045676等位基因分布频率和基因型频率在整体病例组与对照组之间无明显差异;但A等位基因在胸主动脉夹层亚组分布频率高于对照组且有显著性差异,AA基因型增加胸主动脉夹层患病风险(OR=2.684),其余亚组均无显著性差异。另5个SNP位点:rs10263935,rs10757278,rs9806323,rs1036477,rs2118181在病例组及各个亚组和对照组之间的等位基因频率及基因型频率分布无显著性差异。连锁不平衡检验显示:CDKN2B-AS1基因相关的rs10757278,rs1333049之间存在较强水平的连锁不平衡;FBN1基因相关的rs10519177,rs9806323,rs1036477,rs2118181之间存在连锁不平衡,其中rs1036477与rs2118181之间连锁不平衡水平较强。结合各个位点在染色体的距离,结果符合预期。单倍体型分析结果显示,部分FBN1基因相关单倍体型与浙江地区汉族人群胸主动脉瘤发病相关:AAAT组合(OR=2.291)、ATGC组合(OR=5.826)、ATGT组合(OR=11.595)以及GTGT组合增加患病风险;常见单倍体型GAGC组合(OR=0.377)降低患病风险。而CDKN2B-AS1基因相关单倍体型中少见的两种单倍体型,GG组合(OR=9.721)增加浙江汉族人群各类胸主动脉瘤患病风险,AC组合(OR=10.156)仅增加浙江地区汉族女性人群胸主动脉瘤患病风险。多因子降维分析显示:在整体病例组中最佳多因素交互模型为二因子模型由rs1333049和rs10519177组成(Testing accuracy=0.6526, P of permutation<0.0001),十重交叉验证的一致率为10:10,“高危”人群是非上述组合的“低危”人群胸主动脉瘤发病风险的5.31倍,与FBN1相关的rs10519177位点在交互作用中起主导作用。并且此二因子模型对胸主动脉夹层亚组、非遗传综合征胸主动脉瘤亚组及升主动脉动脉瘤亚组均为最优模型。仅在胸主动脉真性动脉瘤亚组最优多因素交互模型为由rs1333049组成的单因子模型(Testing accuracy=0.5622, P of permutation=0.008),十重交叉验证的一致率为9:10,显示CDKN2B-AS1在胸主动脉真性动脉瘤致病因素中的主导作用。结论rs1333049、rs10519177、rs6045676多态性位点与浙江地区汉族人群胸主动脉瘤患病风险相关,FBN1基因和CDKN2B-AS1基因的部分单倍体型会产生不同程度的遗传易感性,FBN1和CDKN2B-AS1基因交互作用在胸主动脉瘤疾病发病过程中起到重要作用。胸主动脉瘤作为一大类疾病,其成因有很强的遗传因素,并且是由多种因素相互作用的复杂过程,采用不同角度的基因多态性与遗传易感性研究,将有助于阐明胸主动脉瘤发病的遗传基础。
其他文献
论文首先介绍了乌当区团委团籍管理系统的研究背景,对所需要解决的问题进行了概述,讨论了项目的研究意义与重要性,阐述了系统开发方法和相关技术;论文提出了系统的设计目标,对
中国改革开放以来,供应链上中小企业迅速发展,已成为国民经济和社会发展的重要力量,但其在发展过程中面临诸多困难,融资难已成为中小企业发展的最大障碍。加之国际和国内经济形势
五千年来,中华民族用自己的勤劳、勇敢和智慧开拓了这片幅员辽阔的国土,共同缔造了统一的多民族国家,在长期的生产生活过程中共同创造了源远流长、博大精深的中华文化。丰富
背景:大部分的先天性心脏病患儿需要依靠手术治疗才能长期存活,其中多数为外科开胸手术。然而,外科开胸手术后患儿需要忍受打开胸腔的巨大痛苦。术后疼痛对于先心病患儿可造成
民国时期是中国社会从封建农奴制社会跨越到社会主义社会的过渡时期,具有承前启后的重要意义。虽然民国社会一直处于外患内忧的动荡时期,但是在治理西藏方面,民国政府与历届
目的心血管疾病是世界范围内严重危害人类健康的疾病,近年来研究显示,其发病率和死亡率在发展中国家日益增高。目前已经有很多研究探讨心肌梗死发病的危险因素并预测发病概率
目的:阐明调控辅激活因子相关的精氨酸甲基转移酶1(coactivator-associated arginine methyl-transferase1, CARM1)基因表达的分子机制,探索其通过何种作用方式参与冠心病的发
阅读和词汇学习之间的关系一直是广为关注的研究主题。注释经常被用在阅读材料中以促进读者的阅读理解和附带词汇学习。然而,很少有研究者将注释和词汇搭配结合起来进行研究。
种植业可持续发展进行分析,然后分析了工业、种植业和生态争水、单一农户如何理性的水是新疆绿洲农业发展的关键,也是新疆农业生产中最重要的自然资源。农业一直以来都是新疆的
闽南方言是古汉语的活化石,在源远流长的发展过程中,闽南方言形成了自己的连词系统,现有的研究材料主要分布于工具书、各市县方言志及部分方言研究著作,这些研究材料中对闽南