SELEX技术体外筛选单增李斯特菌适配子及其荧光快速检测方法的建立

被引量 : 0次 | 上传用户:JxfITRoad
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:本文采用SELEX技术,以单核细胞增生李斯特菌为靶目标,筛选得到一组拥有高亲和力和高特异性的寡核苷酸适配子,并初步建立单核细胞增生李斯特菌的荧光快速检测方法。方法:1.以单核细胞增生李斯特菌为靶目标,人工合成两端为固定序列,中间含37个随机序列,全长为80nt长度的ssDNA文库。应用SELEX技术进行反复9轮筛选,得到一组高亲和力和高特异性的适配子群。为了减少ssDNA与其他细菌的交叉结合,在第5轮用蜡样芽孢杆菌进行反筛,在第7轮用英诺克李斯特菌进行反筛。利用地高辛-抗地高辛碱性磷酸酶显色系统检测各轮筛选产物与单核细胞增生李斯特菌的结合率。2.最后一轮的筛选产物进行扩增、纯化,克隆、测序。应用Chromas2软件分析适配子的测序峰图,DNA MAN软件对测序出来的适配子序列一级结构进行同源性分析,并用RNA Structure软件预测序列的二级结构。3.通过对适配子结合力和特异性检测,选取最佳的一条适配子,运用荧光结合机制来设计分别标记有FAM和TAMRA的两种荧光适配子,初步建立荧光标记适配子直接检测法(FLADA)。结论:1.随着筛选轮数的增加,筛选条件越来越严格,最终得到一组高亲和力和高特异性的适配子群,初步建立了SELEX体外筛选单核细胞增生李斯特菌适配子的技术。利用克隆技术成功的将筛选获得的适配子进行克隆,测序,并将得到的18条序列分为A、B、C三组。A组中的15条序列的随机区片段长度和预期片段的随机区长度一致,B组中2条序列的随机区片段短于预期片段的随机区长度,C组中的1条序列的随机区片段比预期的多了一个碱基。运用DNAMAN软件分析18条克隆适配子一级结构的同源性,除H09序列剩下的17条序列都有较高的同源性,说明经过9轮SELEX筛选,一级结构同源的适配子得到了一定程度的富集。应用RNA Structure软件模拟适配子的二级结构,以茎环结构为主。2.利用地高辛-抗地高辛碱性磷酸酶显色体系对适配子的结合率进行测定,从得到的18个克隆适配子中选取结合率最高的E01号适配子,并将E01号适配子与多种菌种结合,进行特异性检测,E01号适配子与目标菌单核细胞增生李斯特菌的结合力远远大于其他菌种,高达1.017,说明了E01号适配子的高特异性。3.选择FAM和TAMRA两种荧光基团对E01号适配子进行标记,荧光显微镜下可以直接观测到适配子与单核细胞增生李斯特菌孵育后有较强的荧光,而与蜡样芽孢杆菌和英诺克李斯特菌结合的数量就很少。荧光标记适配子与我们目标菌的检测灵敏度可达10~3/ml。初步建立了荧光基团标记适配子快速检测单核细胞增生李斯特菌的检测方法。
其他文献
市政给排水管道作为城市肌体的血脉,是城市基础设施的重要组成部分。随着城市化进程发展需求的不断增强,人们对市政给排水管道的施工质量要求也越来越高,需要采用更加先进的
<正>在俄罗斯艺术是备受推崇的科学,列宾美术学院作为艺术科学院的化身,有着无上的权威和地位,因此它的教学宗旨、教学目的、教学手段很难更改,谁也没有这个权力和这种能力。
CAD/CAM技术的应用,极大的促进了世界模具制造业的发展。对于这类具有复杂型面及轮廓的模具类零件的加工,刀具中心轨迹都是曲线。随着计算机技术的发展,使CNC机床能直接加工空间
利用金相显微镜和透射电子显微镜观察分析了不同轧制道次、不同冷轧变形量及冷轧后的时效处理对GH4169(Incone1718)合金中γ′、γ″、δ相的形貌、分布和大小的影响。结果表明
本文设计了一台三自由度数控龙门切割机,它适用于大、中型平面板材及曲面板材零件的切割加工。该三自由度数控龙门切割机可采用多种切割方法,如激光切割、等离子切割、高压水切
随着建设用地的不断减少,许多建筑物不得不在地质条件不良的场地上进行修建,而原本可被评价为地质条件良好的地基,在特定的情况下也有可能需要进行地基处理。强夯法是地基处理中
A气田储层为致密砂岩,物性控制因素复杂多样,三个目的层段岩性、沉积、储层和物性特征差异明显。利用岩心、薄片、物性、沉积相、测井等资料对储层的沉积作用、成岩作用与储
《企业会计准则第3号———投资性房地产》引入了公允价值计量模式,其操作的关键是公允价值的取得。本文对该准则中公允价值计量的方法进行了探讨,并提出了若干政策建议,以增
<正>商业零售企业销售各种类型的购物卡,其增值税纳税义务的实现时间是购货者取得购物卡时还是持卡者提货时?这个问题一直困扰着商业零售企业,这也是税务机关和商业零售企业
作为第一位非裔女性诺贝尔文学奖获得者,托尼·莫里森已被公认为世界上最杰出且具影响力的作家之一。莫里森作品中交织着性别、种族、权利、阶级、生存等强烈字眼,颇具政治意