基于类修饰DNA探针和免疫竞争法的RNA N~6-甲基腺苷电化学检测方法研究

来源 :重庆医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yx_maomao
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:自RNA化学修饰发现以来,研究者陆续发现了超过150种RNA修饰。其中N~6-甲基腺苷(N~6-methyladenosine,m~6A),被证实是真核生物中含量最丰富的RNA化学修饰之一。生物体内不同水平的m~6A发挥着不同的生物学功能,而这些生物学功能的异常则是导致肿瘤和疾病的重要因素。由于m~6A不会改变其与T和U的碱基互补配对能力,因此不能用标准杂交或测序技术直接检测m~6A;此外,目前缺乏能有效区分m~6A和A的化学方法,且RNA不稳定化学处理过程中降解增多,导致m~6A检测技术的发展进一步受限;致使m~6A的确切生物学调控机制研究进展缓慢。因此,建立一种m~6A快速、准确检测方法对m~6A的研究有着重要意义。方法:本研究以抗m~6A抗体,既能识别RNA中的m~6A也能识别DNA中的m~6A为基础,建立了一种无标记且高特异的电化学免疫传感方法,用于RNA中m~6A的检测。首先,利用组氨酸标记的重组蛋白G(his-PG)将抗m~6A抗体定向固定于金电极表面,以提高抗原抗体结合效率;其次,以合成的类修饰DNA探针(L1)作为信号分子与m~6A-RNA竞争性结合抗m~6A抗体,以拓宽新方法的检测范围;然后,用核糖核酸酶(RNase A)水解与抗体结合的m~6A-RNA,以消除m~6A-RNA长度及碱基序列对检测结果造成的影响,提高准确度。最后,通过检测免疫传感器的电阻抗谱(EIS)信号,实现对RNA中m~6A的检测。结果:在最优的实验条件下,所构建的电化学免疫传感器具有较高的灵敏度和特异性。由于竞争机制的存在,该方法的线性范围较非竞争法有大幅增加,为0.05~200 nM;检测限低至0.016 nM(S/N=3)。此外,该免疫传感器成功实现了对HepG2、L02、HBE和A549细胞系总RNA中m~6A的检测。结论:本研究通过his-PG将抗m~6A抗体定向固定于金电极表面,不仅提高抗原抗体结合效率,而且也保证了每个抗体都能被抗原所饱和,提高方法的重复性。利用类修饰DNA探针作为信号分子与m~6A-RNA竞争结合抗m~6A抗体以扩大线性范围。同时利用RNase A的水解作用,消除了不同长度RNA和碱基序列对检测造成的干扰。在最优的实验条件下,实现了对不同细胞系来源的总RNA中m~6A的检测,证明所构建的电化学免疫传感器,具备准确检测生物样本来源的RNA中m~6A含量的潜力。
其他文献
目的:观察大黄灵仙胶囊干预胆囊结石患者保胆取石术后胆囊收缩功能和结石复发率,探讨大黄灵仙胶囊对保胆取石术后胆囊收缩功能的治疗效果,同时通过基础实验验证大黄灵仙胶囊
以系统功能语言学为基础的多模态文体学,研究交际中语言和非语言符号如何相互作用从而共同产生意义。以图文并茂为特点的绘本对儿童的识字能力、文学阅读和社会认识等方面发
根系分泌物是介导植物-土壤-微生物相互作用、进行物质交换和信息传递的重要媒介,是构成植物不同根际微生态特征的内在驱动因素,也是根际交流的主要调控者。然而,由于收集方
目的①应用小视野多b值ZOOMitTM扩散加权成像,对IVIM模型的纯扩散系数(D)、灌注分数(f)、假扩散系数(D*),DKI模型的平均扩散峰度(MK)、平均扩散率(MD)和传统单指数DWI模型的
研究表明鸡红细胞能转录TLRs,但人们对红细胞的其他基因转录功能仍不清楚;肉鸡胫骨软骨发育不良(TD)可导致大量坏死软骨细胞堆积,前期研究发现重组鸡谷胱甘肽S-转移酶A3(chGS
拓扑结构,作为支架材料表面关键物理性质之一,对包括粘附、增殖、迁移、分化等众多细胞行为具有重要的调控作用。微纳米加工技术的发展使在材料表面可控构建特定微拓扑结构(微图案)成为可能,已成为研究表面拓扑结构与细胞相互作用关系的重要技术手段。但现有研究大多以微纳米沟槽、微岛和微柱等基本拓扑结构为模型,而忽略了对天然骨组织关键拓扑结构特征的仿生。天然密质骨是由大量被称为骨单位(哈弗氏系统)的重复结构单元组
目的:参考心率变异性(HRV)的分析方法,深入研究老年患者睡眠情况、不寐中医证型及心率变异性、衰弱综合征的相关性,为老年患者睡眠情况、不寐中医证型及心率变异性、衰弱综合
目的建立皮质类固醇激素性高眼压大鼠模型,通过对高眼压大鼠使用芪灯明目胶囊混悬液灌胃,观察大鼠的眼压变化情况和小梁网、视网膜形态结构的改变,并初步探索芪灯明目胶囊对
为探究磁场对玉米幼苗生长发育的影响。通过室内水培试验,以北青340为材料,在玉米幼苗两叶一心期通过人工施加外源磁场,研究了玉米幼苗形态、光合特性、抗氧化酶活性、植物生
无花果(Ficus carica)是桑科榕属速生小乔木,具有较高的观赏价值。其果可食,其叶中含有具抗菌、抗病毒、抗肿瘤和降血糖作用的活性成分,被称为“21世纪人类健康的守护神”。