目的应用RNA-seq测序技术及生物信息学分析方法,研究正常大鼠与慢性阻塞性肺疾病（COPD）肺气虚证大鼠的信使RNA（m RNA）和长链非编码RNA（Lnc RNA）的表达差异及相关性,探讨COPD肺气虚证大鼠在m RNA和lnc RNA水平的潜在标记物,为COPD肺气虚证的客观化研究提供理论与实践依据。方法1.COPD肺气虚大鼠模型复制将20只清洁级（SPF）SD大鼠随机分为正常组和模型组,延续团队复制COPD肺气虚大鼠模型方法及预实验,通过烟熏（CS）联合脂多糖（LPS）气管滴注法,复制COPD肺气虚证大鼠模型。依据大鼠的肺功能、肺组织病理、慢性炎症改变、咳嗽、喘息、呼吸、毛发等一般情况,评价COPD肺气虚大鼠模型的建立。2.RNA测序及生物信息学分析使用Illumina Hi Seq 4000测序平台,检测大鼠肺组织中m RNA和Lnc RNA的表达;基于测序结果,应用RNA编码能力预测、RNA定量分析、组间差异分析、聚类分析、Lnc RNA靶基因预测、m RNA基因注释、富集分析等生物信息学分析方法,筛选差异表达的Lnc RNA和m RNA,分析二者之间的相关性,预测Lnc RNA的靶基因及其潜在的功能,寻找潜在的COPD肺气虚证生物标记物。结果1.与正常组大鼠相比较,COPD肺气虚证大鼠的表现为精神状态差、呼吸短促、咳嗽、喘息、毛发失荣等。2.肺功能结果显示:与正常组大鼠相比,模型组大鼠肺功能参数:FVC、FEV0.3、FEV0.3/FVC均显著下降（P<0.05）,且符合COPD肺功能改变;大鼠肺组织病理结果显示,模型组表现为肺泡扩张、融合,肺间隔断裂及肺气肿等改变。3.大鼠血清IL-10、IL-23、IL-32表达结果显示:模型组大鼠血清IL-10表达下调（P<0.05）;IL-23、IL-32表达上调（P<0.05）。4.RNA测序和生物信息分析结果:（1）显著差异的已知m RNA有550条,显著差异的新m RNA有237条,显著差异的已知Lnc RNA有753条,显著差异的新Lnc RNA有134条;（2）组间显著差异Lnc RNA靶基因结果显示:共有109对Lnc RNA-m RNA互作关系,其中涉及72个lnc RNA和90个m RNA;（3）GO富集分析结果显示,组间显著差异的m RNA,（1）在生物学进程（biological process）层面,差异表达的m RNA主要富集于细胞进程（1016条m RNA）、生物调节（760条m RNA）、代谢过程（765条m RNA）、生物过程调节（735条m RNA）等;（2）在细胞组分层面:细胞（1054条m RNA）、细胞组分（1053条m RNA）、细胞器（866条m RNA）等;（3）在分子功能层面:结合（941条m RNA）、催化剂（412条m RNA）等。（4）通过KEGG富集分析结果显示:组间显著差异的Lnc RNA靶向的显著差异m RNA主要分布在:脂肪细胞因子信号通路、蛋白质的消化和吸收、脂肪的消化和吸收等代谢通路,及NF-κB、TRP通道的炎症介质调节等免疫信号通路;（5）综合Lnc RNA靶基因预测及富集分析预测,Lnc RNA:LTCONS＿000478-37、LTCONS＿00048719、LTCONS＿00048721、NONRATT017677.2、LTCONS＿0-0048720、LTCONS＿00048723、NONRATT028939.2、LTCONS＿00062784参与调控脂肪、蛋白质等相关通路的m RNA,调控营养物质的代谢。结论1.借助RNA-seq技术和生物信息学分析方法,发现COPD肺气虚证大鼠存在大量差异表达的m RNA和Lnc RNA,存在潜在的COPD肺气虚证生物标记物。2.通过对显著差异表达的m RNA和Lnc RNA进行互作分析和功能预测,发现Lnc RNA:LTCONS＿000478-37、LTCONS＿00048719、LTCONS＿00048721、NONRATT017677.2、LTCONS＿0-0048720、LTCONS＿00048723、NONRATT028939.2、LTCONS＿00062784可能是COPD肺气虚的生物标记物,通过调控机体营养代谢,影响机体的免疫力,参与COPD肺气虚的发生发展。