根据内生增长理论，科技创新是超长期经济增长的源泉。在新时代的背景下，全球的经济贸易合作不断增强。全球范围内的经济、政治、文化交流已经成为了一股不可逆的潮流，只有参与其中才能谋求更大的发展。不同的国家、不同的经济体之间的合作与竞争也变得更加的紧密和激烈。然而，要想在这场竞争中立于不败之地，就必须要有强大的科技实力作保障。所以在我国的“十二五规划中”结合我国的实际情况也明确提出，坚持把科技进步和创新作为加快转变经济发展方式的重要支撑。而财政科技投入对科技进步和创新有巨大的推动作用。于是，如何评估科技投入的效率，从而为政府合理的安排科技投入的总量和结构提供参考，就成为了一个重要的并且亟待解决的问题。　　 本文首先对财政科技投入的研究现状做了介绍，然后阐述了于财政科技投入效率评价相关的重要理论，包括了科技创新理论、内生增长理论和区域经济理论。接着本文将我国分为东部地区、中部地区、西部地区三大区域。并从这一角度出发，对我国的财政科技投入的现状进行分析。文章的主体部分是使用DEA模型对我国三大区域的财政科技投入分别做了效率评估。并且，在实证分析的基础上给出了三大区域的财政科技投入的政策建议。　　 本文的贡献和创新之处有以下几点：⑴从区域的角度对财政科技投入进行总量和结构分析。不单单是时间轴上的纵向比较。更是不同区域之间的横向比较。从而对我国的财政科技投入的使用情况有了一个更加清晰明了的认识。⑵使用DEA模型从区域的角度对财政科技投入进行效率评估。数据包络分析法(即DEA模型)是一种先进的多指标分析法，但是作为一种计量方法也存在局限性，即有对数量的分析，而没有将质量因素考虑进去。例如，投入指标“从事科技活动的人员”，不同省份间人员的技术水平有较大差距。而如果从区域的角度进行评价，通过东部地区、中部地区、西部地区的分组，在组内使用DEA模型进行分析。则可以将这种质量对评价结果的影响减小，从而得到更准确的评价结果。⑶结合实际情况和实证分析的结果给三大区域的不同省份提出了相关的政策建议。希望可以给政府的财政科技投入提供有益的参考。