由于叶绿体和线粒体DNA和细菌16S r DNA之间具有序列同源性,且内生细菌的数量较少,从而影响基于16S r DNA扩增-高通量测序方法得到的内生细菌多样性信息。本研究首先探讨了研磨叶片的缓冲溶液种类、酶处理植物细胞壁、梯度离心、叶片质量和特异性引物对东南景天叶片内生细菌DNA质量和多样性的影响,筛选出理想的DNA提取方法和扩增引物。进一步采用优化的方法研究土壤锌污染水平对东南景天叶片内生细菌群落结构的影响。本论文取得的主要研究结果如下:（1）叶片经过方法B酶溶液3-20（酶溶液:0.75g离析酶R-10+0.75g纤维素酶R-10+4.275g蔗糖溶于50m L去离子水）预处理后,后续获得的内生细菌DNA质量最好;高通量测序得到的序列中,植物叶绿体DNA占总DNA的比例减少,分别比方法ABCE-20和CNa Cl+SDS-20预处理的叶片样品中叶绿体DNA比例低82.40%和84.78%;同时获得的叶片内生细菌α多样性最丰富,OTU分类单元数量,Chao1指数、Shannon指数与Simpson指数均显著高于其他叶片预处理方法。叶片预处理过程中增加Nycodenz密度梯度离心,能够有效减少叶绿体和线粒体DNA含量,但同时使检测到的内生细菌OTU分类单元数、物种数和多样性指数显著减少。此外,提取DNA的叶片质量也影响DNA质量。例如,当叶片质量为20 g时,叶片经过方法B酶处理3预处理后,得到的DNA质量最好,检测到的物种数和α多样性指数最高。（2）采用引物799F-1193R扩增内生细菌16S r DNA片段V5V7区域,可以很好地避免扩增叶绿体和线粒体DNA,从而显著提高高通量测序中内生细菌DNA序列的比例,检测到的物种数、Chao1指数、Shannon指数与Simpson指数与扩增V3V4、V4、V4V5区的样品没有显著差异,但低于扩增V1V2区样品。（3）土壤Zn污染水平对东南景天叶片内生细菌多样性有一定的影响。当土壤Zn浓度为0、250、500 mg·kg-1时,检测到的物种数和Chao1没有显著差异;但当土壤Zn浓度为1000 mg·kg-1时,叶片内生细菌的物种数、Chao1和Shannon指数和Simpson指数显著增加。在门水平,生长在4种土壤上的东南景天叶片内生细菌的优势菌均为厚壁菌门（Firmicutes,43.38%～78.20%）、变形菌门（Proteobacteria,18.08%～49.40%）、放线菌门（Actinobacteria,1.37%～6.94%）和拟杆菌门（Bacteroidetes,1.87%～2.54%）。在纲水平,生长在4种不同锌污染水平土壤上的东南景天叶片内生细菌的第一优势菌均为杆菌纲（Bacilli,43.15%～78.13%）,但其相对丰度在不同土壤存在显著差异,在Zn500土壤上相对丰度最大;随着土壤Zn浓度的增加,γ-变形菌纲（Gammaproteobacteria）和β-变形菌纲（Betaproteobacteria）的相对丰度逐渐减少,放线菌纲（Actinobacteria）的相对丰度表现为先减少后增加的趋势。在属水平,生长在4种土壤上的东南景天叶片内生细菌的优势菌均为短芽孢杆菌属（Brevibacillus,9.44%～17.34%）、芽孢杆菌属（Bacillus,3.39%～11.51%）、嗜麦芽窄食单胞菌属（Stenotrophomonas,2.38%～4.01%）、类芽孢杆菌属（Paenibacillus,1.89%～2.73%）、红球菌属（Rhodococcus,0.40%～4.26%）、肠杆菌属（Enterobacter,1.44%～6.20%）。随着土壤Zn浓度的增加,短芽孢杆菌属、嗜麦芽窄食单胞菌属和红球菌属的相对丰度先减少后增加,芽孢杆菌属和肠杆菌属的相对丰度先增加后减少,类芽孢杆菌属的相对丰度随着锌浓度的增加而增加。（4）RDA分析发现叶片内生细菌群落结构受叶片生物量、土壤Zn浓度和叶片Zn浓度的影响,其中Gammaproteobacteria、Betaproteobacteria、Actinobacteria、Sphingobacteriia纲的相对丰度均与叶片Zn含量成显著负相关关系（P＜0.05）,Deltaproteobacteria纲的相对丰度与叶片Zn含量成正相关关系（P=0.068）,但没有达到显著水平;Bacteroidia纲的相对丰度与土壤Zn浓度成显著负相关关系（P＜0.05）,与叶片生物量成正相关关系（P=0.288）。