【摘 要】
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目的:以孤独症谱系障碍（autism spectrum disorder,ASD）动物模型BTBR小鼠作为研究对象,采用RNA测序（RNA-sequencing,RNA-seq）技术进行BTBR小鼠大脑皮质转录组学分析,从而丰富人们对于ASD发病机制的认识,更可以为寻找ASD的诊断标记物及药物治疗靶点提供新的方向。方法:1.分别取BTBR小鼠和对照组C57BL/6J（B6）小鼠大脑皮质组织,提取总
【基金项目】
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国家自然科学基金“微管结合蛋白 STOP 参与孤独症发病的机制研究（编号:81671364）”2017.01-2020.12,57万元；
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目的:以孤独症谱系障碍（autism spectrum disorder,ASD）动物模型BTBR小鼠作为研究对象,采用RNA测序（RNA-sequencing,RNA-seq）技术进行BTBR小鼠大脑皮质转录组学分析,从而丰富人们对于ASD发病机制的认识,更可以为寻找ASD的诊断标记物及药物治疗靶点提供新的方向。方法:1.分别取BTBR小鼠和对照组C57BL/6J（B6）小鼠大脑皮质组织,提取总RNA,并通过磁珠富集m RNA,再通过反转录构建c DNA文库,使用Illumina Hi Seq4000测序仪进行测序。2.对测序结果进行过滤和质控,获得最终可用数据。参考基因组比对,获得基因表达量结果。将实验组与对照组数据进行比较,筛选差异表达基因（differential expressd genes,DEGs）,并对其进行GO功能富集分析。3.筛选4个与ASD或脑发育相关的DEGs,采用实时荧光定量PCR技术对筛选的DEGs进行验证。结果:1.成功构建了c DNA文库,进行了测序,对测序结果进行过滤和质控,结果显示测序数据质量较高,可进行分析。2.在BTBR小鼠与B6小鼠的大脑皮质中,存在着1271个DEGs,其中BTBR小鼠有575个DEGs相比于B6小鼠上调,696个DEGs下调,GO功能富集提示DEGs主要参与了免疫反应、细肌丝滑动、膜攻击复合物的激活与调节等功能。3.实时荧光定量PCR结果显示,筛选的4个DEGs相对表达情况与RNA-seq的结果相一致。结论:1.本研究通过RNA-seq技术及生物信息学方法,成功对ASD动物模型BTBR小鼠脑皮质组织进行了转录组学分析,经过实时荧光定量PCR实验的验证,鉴定本次测序结果较为理想。2.本研究发现BTBR小鼠与B6小鼠大脑皮质中存在着1271个差异表达的基因,其中一些基因与ASD及脑发育过程有着明显的联系。以这些基因及上下游调控的因子为基础,可为ASD诊断标记物的找寻提供新的方向,并为ASD的治疗提供一些可能的药物靶点。
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