褐藻胶裂解酶的分子改造及构效分析

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褐藻胶裂解酶降解褐藻胶制备褐藻寡糖,褐藻寡糖可以应用于医药、农业、食品等行业。由于野生菌株存在酶蛋白表达量少、分离困难等问题,所以难以实现大规模的工业化生产。本文构建了胞内表达的褐藻胶裂解酶E226K,通过定点突变以及关键位点的饱和突变等方法提高了酶蛋白的热稳定性和催化活力,并基于分子动力学模拟的手段,揭示其催化特性发生改变的结构机理。主要研究结果如下:1.褐藻胶裂解酶E226K的理论分子质量为29.3 k Da,等电点4.42,由较多的β-折叠和一个螺旋组成一种无信号肽、无跨膜区的亲水性、稳定性好的酶蛋白。构建了胞内表达菌株BL21(DE3)-p ET-28a(+)-E226K,于16℃、IPTG终浓度0.05 mmol/L进行诱导表达24 h。采用DNS法测定酶活力,考马斯亮蓝G250法测定蛋白含量,计算E226K的比活力为80.41 U/mg。2.以重组质粒pET-28a(+)-E226K为模板,根据催化腔附近氨基酸的性质、“盖子”结构以及催化腔入口的空间位阻,采用定点突变以及关键位点的饱和突变等方法,筛选到比活力提高274%的突变体I38T/R121V。3.E226K和突变体I38T/R121V的最适反应温度和最适反应p H值均为55℃、p H7;Na+、K+、Mg2+对两者均有促进作用,Co2+、Mn2+、Cu2+、Ag+有明显抑制作用;E226K的最适Na Cl浓度为1.0 mol/L,突变体I38T/R121V的最适Na Cl浓度为0.5 mol/L;突变体I38T/R121V对EDTA的敏感度略高于E226K。4.最适温度55℃(328K)时,突变体I38T/R121V的半衰期(t1/2)较E226K提高了177%;Km值、Kcat值、Kcat/Km分别是E226K的61.5%、3.6倍、5.8倍,说明突变后酶蛋白的催化效率明显提高。5.分子动力学模拟表明:突变提高了酶蛋白Loop1(A35-G44)氨基酸残基及催化腔入口处组成α-螺旋的氨基酸残基的柔性,优化了突变位点附近的能量分布,减小了糖链非还原端结合位点的空间位阻,增加了活性中心同底物的相互作用力,导致亲合能提高,底物更易结合在催化腔中,有利于质子的传递和水解的发生,从而提高了酶蛋白的催化效率。同时,酶蛋白的分子内相互作用力更为复杂,骨架的刚性略有提高,促使突变体具有更强的热稳定性。
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