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Ⅰ胃癌相关circRNA-miRNA-mRNA网络构建和分析胃癌(Gastric cancer,GC)是一种复发率高的恶性肿瘤,是世界范围内第五大常见的癌症和癌症相关死亡的第四大原因。环状RNA(Circular RNA,circRNA)是一种新型非编码RNA,在人类肿瘤研究中受到越来越多的关注。越来越多的研究表明circRNA参与肿瘤的发生发展,并有望成为肿瘤的新型生物标志物和治疗靶点。然而,在胃癌中仍有许多未知的circRNA,其在胃癌中的作用亦需要进一步的研究。本研究中,我们从胃癌相关的微阵列和高通量测序数据集中筛选出6个差异表达circRNAs(Differentially expressed circRNAs,DECs),并通过Sanger测序和核糖核酸酶R(Ribonudease R,RNase R)抵抗性实验验证了它们的成环特性。进一步对胃癌样品进行RT-qPCR分析证实,这6个DECs(hsa_circ_0000390、hsa_circ_0000615、hsa_circ_0001438、hsa_circ_0002190、hsa_circ_0002449和hsa_circ_0003120)在胃癌组织中表达下调,且它们均主要分布于细胞质中。通过在线数据库预测这6个DECs的miRNA(MicroRNA,miRNA)结合位点及AGO2结合位点,共鉴定出包含6个DECs与33个miRNA之间的相互作用。然后,对这33个miRNA的靶基因进行预测得到5320个靶基因,并通过挖掘肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库获得在胃癌中差异表达的基因,共有1492个。对上述5320个靶基因与在胃癌中表达下调的889个基因取交集,得到320个下调的共表达基因。京都基因与基因组百科全书(The Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析表明该320个基因与两条重要的肿瘤信号通路有关。然后,我们利用STRING构建了一个包含该320个基因的蛋白互作(Prorein and protein interaction,PPI)网络,并从中筛选出15个关键基因(ATF3、BTG2、DUSP1、EGR1、FGF2、FOSB、GNAO1、GNAI1、GNAZ、GNG7、ITPR1、ITPKB、JUND、NR4A3和PRKCB)。此外,我们通过CMap数据库筛选出以这15个关键基因为基础的用于治疗胃癌的3种潜在药物,分别为伏立诺他(vorinostat)、曲古抑菌素A(trichostatin A)和阿司咪唑(astemizole)。总结,我们通过运用数据挖掘、湿实验和计算生物学的综合策略,发现了胃癌相关的新的circRNA(hsa_circ_0000390、hsa_circ_0000615、hsa_circ_0001438、hsa_circ_0002190、hsa_circ_0002449和hsa_circ_0003120),并进一步构建了circRNA-miRNA-mRNA分子调控网络,表明这6个circRNA可能作为竞争内源性RNA(Competitive endogenous RNA,ceRNA)在胃癌中发挥作用。此外,通过CMap分析,我们筛选出3种用于治疗胃癌的潜在药物(伏立诺他、曲古抑菌素A和阿司咪唑)。本研究从circRNA-miRNA-mRNA角度为研究胃癌的发病机制和治疗策略提供了新的思路。ⅡHsa_circ_0001829在胃癌中的体内功能和临床意义研究胃癌(Gastric cancer,GC)的发生涉及多种因素,其中化学致癌物的长期接触是最重要的因素之一。N-甲基-N’-硝基-N-亚硝基胍(N-methyl-N’-nitro-N-nitrosoguanidine,MNNG)是一种代表性的环境致癌物,其被认为与胃癌的发生密切相关。课题组前期研究发现环状RNA(Circular RNA,circRNA)在MNNG诱导的胃癌发生发展中起着重要的作用,其中hsa_circ_0001829已被证实通过miR-155/SMAD2通路促进胃癌的进展。然而,hsa_circ_0001829在胃癌中的体内功能以及临床价值仍有待进一步的研究。本研究通过构建胃癌皮下异种移植瘤及转移模型,证实沉默hsa_circ_0001829表达可在体内抑制肿瘤的生长和侵袭。随后我们利用RNA原位杂交技术(RNA in situ hybridization,ISH)对含98例胃癌和82例癌旁正常组织的组织芯片进行hsa_circ_0001829的染色分析。通过对组织芯片ISH染色结果分析发现,在胃癌组织中hsa_circ_0001829的表达水平较癌旁组织有明显的升高(P<0.0001)。Hsa_circ_0001829水平与胃癌患者临床病理参数相关分析表明hsa_circ_0001829水平与肿瘤大小、N分级和AJCC7th分期有关。然后结合胃癌患者的临床随访数据,利用Kaplan-Meier法进行生存分析,结果表明hsa_circ_0001829高表达胃癌患者的总体生存时间明显短于hsa_circ_0001829低表达患者(p=0.0015)。单因素和多因素cox回归分析结果表明hsa_circ_0001829表达水平是胃癌患者总体生存期的独立预后因素。总结,本研究证实了hsa_circ_0001829在体内起着促癌的作用;hsa_circ_0001829在胃癌组织中表达显著上调,hsa_circ_0001829高表达的胃癌患者预后更差,且hsa_circ_0001829是胃癌患者预后的独立预测因素。