发酵食品源细菌菌株库的构建及聚类分析研究

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在一些天然发酵食品中,存在着一些对发酵食品生产具有很高经济价值的细菌,这是一类很重要的微生物资源。本试验的目的在于研究这些菌株的特征及其生态分布情况,找出规律,为新菌种的开发研究提供理论依据。 采集了来源于国内外的天然发酵食品样品53个。从这些样品中筛选出了187株细菌,并进行了保藏。从新分离的和原来保藏的菌株中,选择了革兰氏阳性菌株110株和7株参比菌株,进行了菌株表型特性的测定。在表型特征上,选择了一些能够影响食品品质的性状及细菌分类的一些性状,共126个表型性状进行了测定,在此基础上进行了聚类分析。 聚类分析的结果是由中国科学院微生物研究所的MINTS软件自动生成的。在进行聚类分析时,去掉完全相同的表型性状23个,对103个表型特征的测定结果进行了聚类分析,对待试菌株的生态分布、菌株表型特征的聚类情况进行了分析。全部供试菌株在69%的相似水平上聚在一起,在71%相似水平上分为三个类群,在81%的相似水平上分又分为6个亚群。对所采用的103个性状进行聚类分析,发现在25%的相似水平上聚在一起,在48%的相似水平上,分为了3个群。在这几个相似性水平上,对菌株的聚类和测定特性聚类作了分析。 构建了菌株信息输入与检索系统,它为研究人员提供一个公共平台,有利于菌株信息的安全和维护。以研究室近几年收集的菌株,自己分离的菌株及相关信息为基础,同时结合试验中测得的菌株性状信息构建了食品来源的细菌菌株库,此菌株库收集了近400株细菌菌株及其相关信息。
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