口蹄疫是由口蹄疫病毒感染偶蹄动物所引发的高度接触性传染病。全世界范围内几乎每年都有口蹄疫暴发,所造成的直接经济损失巨大。口蹄疫病毒和其他RNA病毒一样具有极高的突变率,它在传代过程中的遗传变异分析,是口蹄疫疫苗研制中不可或缺的环节。VP1基因是参与构成病毒粒子的主要中和抗原位点,可以诱导动物机体产生中和抗体及其它保护性免疫反应,VP1基因的核苷酸是四种结构蛋白中变异率最高的。对VP1基因的分析不仅对口蹄疫病毒遗传变异及灭活疫苗生产用毒株的稳定性研究具有指导作用,而且对口蹄疫的流行病学调查、疫源追踪、甚至新型疫苗的研制等都具有重要意义。AsiaⅠ型FMDV近年来在中国及亚州呈大幅上升的趋势,原有O型单价苗已不能覆盖当前的疫病流行范围。因此,迫切需要研制出O型、AsiaⅠ型二价灭活疫苗用于口蹄疫的防治。本论文扩增了经不同宿主系(乳鼠、BHK21细胞)连传不同代次的AsiaⅠ-KZ/03毒株的VP1基因,命名为MF1、MF5、MF7、CF3、CF10、CF15,利用DNAstar序列分析软件对其进行序列分析,并与目前流行毒株的VP1基因进行分析比较,以此验证制苗用毒株的遗传稳定性,为疫苗研制过程中生产用乳鼠毒和生产用细胞毒毒种传代基数的确定提供科学依据。结果显示,所测6株毒株VP1基因全长633个核苷酸,编码211个氨基酸;传代毒株间核苷酸同源性在99.4-99.8%,推导氨基酸序列的同源性为98.6%-100%;与MF1相比,未发生缺失或插入现象。在氨基酸高变区及主要抗原位点RGD序列、G-H环、T、B细胞表位、Sau3AⅠ限制性内切酶的酶切位点等均具有较稳定的遗传特性,说明以此毒株制备的灭活疫苗是稳定的,适合用于该毒株曾经流行过的区域内相关家畜的免疫预防。