中华鳖是我国高价值的商业淡水物种,2018年养殖产量超过31.9万吨。然而,近年来高密度的养殖和环境恶化,导致由嗜水气单胞菌引起的疾病屡见不鲜,给我国中华鳖养殖产业造成了极大的困扰。在鳖病害方面,寻找免疫基因已成为研究热点。本实验对腹腔注射嗜水气单胞菌的中华鳖的血液进行了生化指标测定,并对肝脏和脾脏组织进行了转录组分析,以探索嗜水气单胞菌对中华鳖免疫应答机制。本论文的研究内容可概括如下:1.嗜水气单胞菌生长特性及对中华鳖免疫生化的影响利用分光光度计和菌落计数的方法制作了嗜水气单胞菌的生长曲线,该菌的生长存在明显的分期,3-9h、9-15h和17-24h分别为它的迟缓期、对数生长期和稳定期。通过2.59×10~8、3.70×10~8、1.85×10~9、3.70×10~9、5.55×10~9CFU/m L浓度梯度的菌液腹腔注射鳖,得出半数致死浓度为1.39×10~9CFU/m L。嗜水气单胞菌感染使中华鳖血液中的碱性磷酸酶（ACP）和酸性磷酸酶（ALP）含量降低,谷丙转氨酶（ALT）活性升高。血液酶活和解剖观察结果均表明嗜水气单胞菌会对中华鳖肝脏和脾脏产生损伤。2.中华鳖免疫通路和基因的筛选及鉴定以感染的鳖的肝脏和脾脏为材料进行转录组测序,在肝脏和脾脏中分别获得4,092和5,793个差异表达基因。采用权重基因共表达网络分析的方法对转录组数据进行分析,得到了14个网络模块。通过筛选发现乳白色、棕色、黄绿色和蓝绿色模块为组织特异性模块。对组织特异性模块进行GO和KEGG功能富集分析,GO富集显示乳白色、棕色、黄绿色和蓝绿色模块中分别有53、20、34、337个差异表达基因,KEGG富集结果表明蓝绿色模块中大部分通路与免疫有关,这些通路主要为细胞因子与细胞因子受体的相互作用、细胞凋亡、MAPK信号通路、Toll样受体信号通路、产生Ig A的肠道免疫网络、NOD样受体信号通路和RIG-I样受体信号通路,Toll样受体信号通路中大部分基因被激活,可能为关键通路。通路中的免疫基因可大致分为5类:toll样受体、白介素及受体,干扰素受体、趋化因子及受体和肿瘤坏死因子及受体等。挑选了蓝绿色模块中的39个免疫基因进行共表达网络可视化,找到了4个枢纽基因IKBKE、CSF2RB、IL15RA和Pelodiscus＿sinensis＿new Gene＿68865。最后,为了验证转录组测序的可靠性,随机挑选9个免疫相关基因进行q RT-PCR验证,验证结果与转录组测序分析结果一致。本研究成功挖掘中华鳖感染嗜水气单胞菌产生免疫应答的关键通路,并发现了大量的免疫基因,为免疫机制研究提供了参考价值。