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目的:通过对产前患有先天性心脏病（Congenital heart defect,CHD）胎儿的羊水细胞进行染色体核型分析、低深度全基因组测序（Copy number variation sequencing,CNV-seq）以及全外显子组测序（Whole-exome sequencing,WES）,探讨先天性心脏病的遗传学病因。方法:1.选取2019年3月至2021年11月因“胎儿先天性心脏病”于山西省妇幼保健院行产前诊断的104例孕妇为研究对象。2.对超声提示胎儿心脏结构异常的104例孕妇行羊膜腔穿刺术抽取羊水,并对每例标本分别行染色体核型分析及CNV-seq检测,对比两种技术检出的胎儿染色体异常结果,对染色体核型分析及CNV-seq检测均正常的CHD胎儿,经孕妇及家属知情选择后行WES检测,并对其妊娠结局进行随访。3.采用SPSS 23.0软件对数据进行分析,计量资料用（均数±标准差）表示,组间率的比较采用χ~2检验,以P＜0.05为差异有统计学意义。4.本研究获得山西省妇幼保健院伦理委员会批准,所有研究对象均签署知情同意书。结果:1.104例入组样本染色体核型分析及CNV-seq均检测成功,成功率100%。2.染色体核型分析检出胎儿染色体正常88例（84.62%）,染色体异常16例（15.38%）。其中染色体结构异常2例（1.92%）;染色体数目异常14例（13.46%）,具体包括21-三体6例（42.86%）,18-三体4例（28.57%）,13-三体1例（7.14%）,45,X 1例（7.14%）,47,XYY 2例（14.29%）。3.CNV-seq检出染色体正常（正常、良性拷贝数变异及可能良性拷贝数变异）74例（71.15%）,染色体异常30例（28.85%）,其中临床意义不明的拷贝数变异7例（6.73%）,明确致病的染色体异常23例（22.12%）。在染色体核型分析正常的88例入组标本中,CNV-seq检出明确致病性拷贝数变异7例,占7.95%（7/88）。4.与染色体核型分析相比,CNV-seq染色体异常检出率高于染色体核型分析,差异有统计学意义（P＜0.05）;CNV-seq联合染色体核型分析染色体异常检出率高于单用染色体核型分析,差异有统计学意义（P＜0.05）。5.104例CHD胎儿中,单发心脏畸形75例（72.12%）,多发心脏畸形29例（27.88%）,多发心脏畸形的胎儿染色体异常的检出率大于单发心脏畸形（48.28%vs21.33%）,两组之间比较差异有统计学意义（P＜0.05）。6.104例CHD胎儿中,单纯心脏畸形65例（62.5%）,合并心外畸形39例（37.5%）;合并心外畸形染色体异常的检出率高于单纯心脏畸形（41.03%vs 21.54%）,两组之间比较差异有统计学意义（P＜0.05）。7.104例CHD胎儿中,共检出23例致病性染色体异常胎儿,具体包括:21-三体6例、22q11.2微缺失微重复6例、18-三体4例、47,XYY 2例、13-三体1例、45,X 1例、其他染色体缺失或重复3例。8.未检测出染色体异常的74例心脏畸形胎儿中,经知情选择后3例染色体核型分析及拷贝数变异均正常的CHD胎儿行WES检测,其中1例检测出FLNA基因（细丝蛋白A）变异,余2例在检测范围内未发现与之相关变异。结论:1.CHD胎儿中,CNV-seq较染色体核型分析染色体异常检出率高。2.在部分染色体核型分析及拷贝数变异均未见异常的CHD胎儿中,WES检测出与CHD相关的致病基因。3.染色体核型分析、CNV-seq及WES合理联用,可有效提高CHD胎儿染色体及基因异常的检出率,减少遗传因素所致CHD患儿的出生。4.与单发心脏畸形相比,多发心脏畸形的CHD胎儿染色体异常率高。5.与单纯心脏畸形相比,合并心外畸形或超声软指标异常的CHD胎儿染色体异常率高。