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由Xanthomonas.oryzae pv.oryzicola(Xoc)引起的细菌性条斑病和由X.oryzae pv.oryzae(Xoo)引起的白叶枯病是水稻生产中危害严重的两种细菌性病害。白叶枯病菌与水稻抗病基因之间存在典型的特异性互作，培育和种植抗病品种是防治水稻白叶枯病最有效手段之一。Xoc与Xoo亲缘关系相近，但是水稻在细菌性条斑病抗性改良方面进展缓慢，其主要原因是水稻对Xoc的抗性由多基因控制。随着分子生物学技术的发展，利用非寄主抗性基因可能是培育广谱持久抗病品种的新途径。
本研究一方面利用农杆菌介导法将从玉米中克隆的细菌性条斑病非寄主抗性基因Rxo1导入到水稻中，采用全基因组芯片和RT-PCR等方法分析了转基因水稻株系抗细菌性条斑病的分子机理；另一方面采用Xoo代表菌株人工接种水稻回交群体，筛选抗白叶枯病水稻株系，定位数量抗性座位(QTL)。主要研究结果如下：
1.携带非寄主抗性基因Rxo1的转基因植株接种Xoc后产生典型的HR表型。组织学分析发现转基因植株的叶片接种后木质素、胼胝质和酚类等基础抗病物质积累增加；过氧化物酶和β-1，3葡聚糖酶等酶类的活性提高。
2.利用Affymetrix全基因组芯片，分析Rxo1转基因植株(9804-Rxo1)及其受体(9804)接种Xoc后基因表达谱，鉴定了可能参与抗病反应的主要基因。结果表明接种后36h，在9804-Rxo1和9804中分别有175个和379个基因差异表达，其中175个(Differentially expressed gemes，DRGs)中92.00％的为上调，且多达48.22％的DRGs为防御反应相关基因。在转基因植株中过氧化物酶(Peroxidase，POD)、脂氧合酶(lipoxygenase2.1，LOX)、病原相关蛋白和萜烯合酶家族蛋白以及C2H2、WRKY与myb类转录因子接种后诱导表达。接种后48h，9804-Rxo1和9804的DRGs分别为2450和1950个，其中HR和SA、ET信号传导途径的关键基因在转基因植株中显著差异表达；SAPK和PPR家族的基因、WRKY和MYB转录因子可能参与抗病反应。
3.分析了SAPK家族基因在携带寄主R基因和非寄主R基因水稻株系中的表达谱。携带Rxo1的植株接种Xoc后，4个SAPK上调表达，其中SAPK9快速持续地高水平表达；携带白叶枯抗病基因Xa23的植株接种Xoo后，4个SAPK被诱导表达。此外，抗性株系接种后内源ABA水平上升；结合蛋白质序列分析，推测motif6(GM[DE]MPIMHD[GS]DR)和/或motif7(IN[QH][FI]L[TN]D[GS]LDDDM)可能与ABA反应相关。
4.用8个非目标性状优良的水稻回交群体，人工接种14个Xoo代表菌株，筛选获得23个广谱抗性株系；定位到了65个白叶枯病各小种抗性相关的QTL(包括13个主效QIL)，有25个标记至少在3个不同的群体或同一群体的不同菌株环境下被定位到；这25个标记中有9个等位基因的抗性来源于轮回亲本HHZ(加性效应为正)；另9个的抗性来源于各供体，其余的7个标记的抗性来源因菌株而异。
本研究从分子水平证明了非寄主抗性基因可以在异种植物中介导HR反应，暗示寄主抗病基因和非寄主抗性基因可能有部分相同的抗病分子机制，为深入研究非寄主抗性基因抗病机理提供了理论基础；同时筛选到的广谱抗白叶枯病材料和定位到的主效QTL将为通过分子育种手段改良水稻品种的白叶枯病抗性提供基础材料。